如果只需要进行较少或较小的修改，就应该马上认真修改后再投寄出去。如果建议进行较大的修改，就应该静下心来对文章和所提建议进行全面认真的考虑.一般可能有以下几种情况：
第一，审稿人发现稿件中存在有严重的问题，并且审稿人的意见是正确的，就应该遵循审稿人的意见，并对稿件做出相应的修改。
第二，审稿人或编辑也有可能对稿件产生严重的误解。如果作者认为审稿人的批评意见是完全错误的，可以有两种处理方案。SCI论文其一是把稿件投向另一刊物，以期望能得到公正合理的评审；其二是再次投稿给该刊，并运用自己所掌握的材料或论据，对审稿人的意见进行逐项详尽的申辩（一定不要使用带有敌对情绪的词语），以期望稿件能送交给其他审稿人进行再次评审。
如果有两位审稿人同时误解作者的表述，作者就需要细心地找出问题或误解产生的原因并进行修改，然后再寄给该刊或其他刊物。一定要认真对待审稿人或编辑提出的修改意见，在返回修改稿的同时附寄一份修改信，修改信中要对审稿人或编辑提出的所有问题逐条回答；对于审稿人推荐的文献一定要引用（这些文献的作者很有可能就是审稿人），并且要讨论透彻；作者如果认为审稿人或编辑的修改建议不合理，就一定要可坚持己见，不必妥协，但一定要有充足的理由。
如果作者收到的是一封退稿信，应该仔细阅读退稿信并决定采取何种处理措施。
第一，完全性退稿(即编辑不会再对稿件予以考虑)。在这种情况下再次投稿给同一家刊物或进行申辩都是毫无意义的。如果稿件中的确存在严重问题，最好不要把它改投给其他的刊物，以免影响作者本人的声誉。如果稿件中还有值得保留的内容，可以将其改写成一篇全新的文章，然后再尝试重新投稿。
第二，稿件包含一些有用的信息，但有些资料有误。首先要仔细阅读稿件和审稿意见，以确认数据是否有严重的错误。若的确是有很大的缺陷，应该认真弥补这个缺陷（如修正错误，补充广泛而有力的证据以及清晰的结论），然后再重新投稿。如果认为是审稿有误，那么，除非能对编辑进行有说服力的证明，否则最好不要将稿件再投给同一家刊物，最好考虑另投其他类似的刊物。
第三，除了所做的实验有一些缺陷外，稿件基本上是可以被接受的。作者可以按照审稿人的意见进行必要的修正，SCI论文然后再次投稿给这家刊物。如果按照审稿人的意见作了重要修改（或重写了某一部分），该修改稿是有可能被重新送审甚至接受的。
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