近年来，太湖流域内年用水总量290亿立方米，而流域内本地区多年平均水资源量只有162亿立方米，剔除因污染不能利用部分，太湖流域3000多万人口年创造近万亿元GDP，用水量竟是实际资源量的两倍。由于太湖流域水污染治理与经济发展和流域人口数量不相协调，流域水体污染十分严重，使太湖流域面临水质型缺水的严峻形势。根据1998～2000年三年间连续水质监测评价表明，尽管近几年来中央和地方各级政府加大了流域水污染防治的力度，但太湖水体水质总体上尚未得到明显好转，湖泊富营养化在整体上也未得到明显改善，2000年总磷、总氮、化学耗氧量均远未达到规划治理目标；河网的水污染没有得到有效控制，部分地方还有恶化的趋势，太湖流域水资源面临严峻的形势。 另一方面，京杭运河与钱塘江沟通后，随着杭州城市的发展，船舶运输在经济建设中发挥重要作用的同时，也产生了许多负面的影响，船舶的噪音和废气的排放，已经严重影响了市民的生活品质，船舶航行发生的多起涉桥事故，对拱辰桥等重点保护文物也构成了不可避免的威胁，货运船舶的参差不齐的外观形象，也与目前的景观河道很不协调，并且已经发生了多起船舶碰撞、损坏景观设施的事故，一定程度上影响了杭州生活品质之城的建设。如果运河杭州到塘栖段停止货运船舶航行，改为完全的旅游河道，旅游经济产生的效益和沿岸房地产业的经济效益，将是巨大的。 因此，开辟钱塘江水系富春江与太湖水系东苕溪的航道，沟通钱塘江太湖流域，引富春江的优质水源，自然流经东苕溪，冲排太湖水系的劣质水，为杭嘉湖地区及上海提供优质水源，改善这些地区的水资源环境，在逐步对污水进行截污纳管后，使京杭运河及其叉河成为杭州、嘉兴等城市的优质自来水源，具有现实的意义和可持续发展的远景。为确保船舶航行安全和水质不受船舶污染、以及节约土地资源，采用具有国际先进水平的电气化轻轨控制船舶航行，从而实现低航道等级、高通航能力的安全型、节约型航行方式，在全国率先实现绿色航运。
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