1、设在机构：内设机构和挂牌机构的区别在于除了不再保留原单位的牌子外，内设机构级别规格原则上低于主体机构，例如市级农业农村局为正处级，畜牧兽医如果设置为农业农村局的内设机构，只能为正科级。县级农业农村局为正科级，内设机构只能为股级。县级内设机构一般不保留单独对外的权利，也不保留印章。
2、挂牌机构：同一机构多个名称多种身份、多个印章。所挂牌子依附于所挂机构，有潜在的主从关系。领导班子只按一套配备，有关成员可以兼“挂牌子”单位的职务。
3、合署办公机构：两个或两个以上的机构由于工作性质相近或联系密切，在同一处所办公，两个机构是平等的。多个印章多个牌子。合署不是合并，合署单位可分别配备行政领导班子（也可兼职）。
扩展资料：
合署办公机构的基本特征：
1、实质是两个机构，分别刻制印章，可以以共同或各自的名义对外开展工作。
2、在党政机构序列中保留各自的名称，机构实体、人员编制及党政领导关系一般列入党委机构，不计入政府机构限额。
3、可分别核定领导职数、配备领导班子。
4、内设一套办公厅（室）、机关党务、干部人事、行政后勤机构。
参考资料来源：济南市市中区机构编制网-合署办公结构
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