制约内蒙古口岸高质量发展的突出瓶颈如下：
1、基础设施不够完善，尤其是部分边境公路和铁路建设相对滞后。这导致了运输效率低下、通关速度慢等问题，影响了物流的顺畅运作。
2、跨境贸易便利化水平有待提高。由于相关法律法规和管理制度的不健全，加上信息沟通不畅等因素，导致进出口手续繁琐、时间较长，进而影响企业的运营效率和经济效益。
3、专业人才短缺问题凸显。随着跨境电商等新兴业态的发展，对专业人才的需求日益增加，而当前内蒙古地区在这方面的人才储备明显不足。
4、缺乏统一的协调机制和市场开放度较低也是亟待解决的问题之一。在促进区域经济一体化过程中，需要加强不同部门之间的协作与配合，共同推动内蒙边口岸高质量发展。
同时，也需要进一步扩大市场开放程度，吸引更多的国内外投资和企业来此发展。以上只是其中一些主要的问题和一些可能的原因，仅供参考！如果有更详细或具体的情况需要了解，建议咨询专业的学者或相关部门。
“十三五”时期年均增长率低于全国外贸增速平均水平的状况也没有得到明显改善等都成为阻碍内蒙地区经济持续增长的因素之一。
因此提升全链条协同能力建设已经成为了刻不容缓的任务。为了解决这些问题需要不断加强体制机制创新和政策支持力度，推动“放管服”、商事制度改革向纵深发展，进一步优化营商环境，促进内外贸一体化程度进一步提升等方面的工作。
此外，还要积极推进中欧班列集结中心示范区建设工作，以带动整个地区的经济发展和社会进步。总之，“提高通关效率”、“降低成本”，以及如何实现这些目标的具体措施已经成为当前内蒙古自治区政府和企业亟需解决的问题。
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