我们现在中学大学里面所有的学科划分，比如生物、地理、物理等学科成型都来自于古希腊的大哲学家亚里士多德。亚里士多德可谓是西方哲学的第1位集大成者，形而上学和形式逻辑的提出者，是科学概念的奠基人。后来亚里士多德的哲学理念与宗教神学观相结合形成院系哲学，成为了中世纪束缚人民思想的统治工具，自然也阻碍了科学的进一步发展。
生活于文艺复兴和理性主义时代之交的英国科学家弗兰西斯培根，对亚里士多德的科学观念充满了否定否定态度。针对亚里士多德写的工具论，他写了一本新工具论进行辩驳。培根批驳亚里士多德将其自然哲学作为其逻辑的奴隶，进而为其诡辩服务。弗兰西斯培根在其著作中强调归纳和演绎，反对单纯的演绎和证明。他认为亚里士多德图提出的形而上学也就是传统的形而上学，多是嘴皮子功夫难以落到实处，就像一个孩子喋喋不休一样，但就是不动手干活。
培根将亚里士多德的科学理念比喻成希腊神话中的居斯拉女神，长着一张处女的脸，但却没有生育能力。在新工具论的前几章里，培根可以说是对希腊科学大加批判，说我们现在所拥有的科学知识大部分来自于希腊人，而希腊人科学完全是坐而论道，沉溺于相互争辩，这恰恰是与探索真理背道而驰的一条道路。他一针见血地指出，希腊人科学没有结出果实。
他认为造成当前科学局面的根子便在于亚里士多德提倡的形式逻辑，这种逻辑是帮助我们找不到新科学的。要想使现在的科学打开局面获得重生，必须突破亚里士多德形式逻辑的束缚，培根尤其讨厌亚里士多德说教般的三段论。培根生活的年代正是自然科学蓬勃兴起的时代，他要为科学呐喊，制定了科学复兴的宏伟蓝图，大力提倡实验科学。培根说科学要发展，必须打破亚里士多德形式逻辑占统治地位的宗教神学束缚。他按照人的理智能力，分为了历史、诗歌、科学三个层次，大力提倡发挥人的主观能动性，直接审视自然界的一切，他是实验科学的创始人。