在AE中设置合成编号的时间格式可以通过修改合成设置来实现。下面是具体步骤：
创建一个新的合成，选择菜单栏中的“Composition”（合成） > “Composition Settings”（合成设置）。
在合成设置窗口中，找到“Start Timecode”（起始时间码）选项。默认情况下，它是从00:00:00:00开始的。
可以手动更改起始时间码，以使它与您的需求相匹配。例如，如果您希望起始时间码为01:00:00:00，则将其更改为01:00:00:00。
在合成设置窗口中，找到“Time Display Style”（时间显示样式）选项。默认情况下，它是以帧为单位显示时间的。
如果您想要以其他时间格式显示时间，可以在“Time Display Style”下拉菜单中选择其他选项，例如“Timecode”（时间码）或“Feet + Frames”（英尺和帧）等。
如果您选择“Timecode”选项，则还可以选择其他时间格式选项，例如24帧或30帧。选择您需要的时间格式，然后单击“OK”按钮以保存设置。
这样设置后，您创建的合成中的时间码将按照您选择的格式进行显示，并且以您指定的时间作为起始时间码。