华中科技大学红十字会的组织架构包括多个职能部门。总队长办公室主要分为三个小组：秘书组，负责日常的文件管理和协调工作，如人事档案、活动档案的管理，以及定期组织会议并记录会议内容。他们还负责人员调度，确保活动期间的顺利进行，并确保信息的畅通，将协会动态传递给会员，同时收集会员的意见和建议反馈给总队长。他们每月需提交活动报表给社联，并在每年5月参与社联的评优活动，同时负责干部的考核与奖证发放。
公益募集部则专注于活动的扩展和资金筹措，他们积极与商家建立联系，寻求经费支持。此外，他们还与省市红十字会保持紧密的交流，与其他学校红十字会和社团合作，并负责与校内如校医院、图书馆、院系和其它协会的联络工作。
新闻媒体部是传播红十字精神和文化的主力军，他们出版《华中大红十字简报》，旨在向全校传播红十字的理念和文化。部门的核心任务是媒体宣传，他们与校内外各大媒体保持良好的关系，确保红十字会的信息能广泛传播。
华中科技大学红十字会于2006年9月份成立，秉承红十字“人道、博爱、奉献”的精神，服务师生、服务社会。为同学提供一个进行自救与急救培训，展示爱心，锻炼自我的平台，提高同学的思想道德水平，培养同学的社会责任感。