首先，当发现论文查重系统中输入的论文题目存在错误时，我们应该及时与相关责任部门或指导老师取得联系，并将错误的论文题目及正确的论文题目准确告知给他们。这样可以避免产生不必要的误解和麻烦。
其次，如果错误的论文题目已经被提交到了查重系统中进行检测，但我们意识到了错误，那么我们可以向相关责任部门或指导老师说明情况，并请求重新输入正确的论文题目进行查重。同时，我们还可以向查重系统的开发者或技术支持人员寻求帮助，看是否能够修改已经提交的论文题目。
此外，为了避免类似错误的发生，我们在进行论文查重时应该养成仔细校对的习惯。在输入论文题目之前，我们可以多次确认论文题目的拼写是否准确，避免因输入错误导致的不必要麻烦。
总之，当我们在论文查重过程中发现输入错误或输错论文题目时，我们应该及时与相关部门或指导老师沟通，将错误情况准确告知给他们，并寻求帮助修改错误的论文题目。通过正确的处理方式，我们可以有效解决这一问题，保证研究生毕业论文查重的准确性和可靠性。