工程审计流程：填写审计资料交接清单并进行登记，进行审前调查；制定审计方案，草拟审计通知书并签发；对审计程序、质量、进度进行跟踪检查，核对工程项目；登记工程核定单，留档留存；复核工程审计工作底稿，编写工程结算审核情况报告；编写财务审计工作底稿，审计结案。 《审计法》 第三十七条审计机关根据审计项目计划确定的审计事项组成审计组，并应当在实施审计三日前，向被审计单位送达审计通知书。 被审计单位应当配合审计机关的工作，并提供必要的工作条件。 第三十八条审计人员通过审查会计凭证、会计帐簿、会计报表，查阅与审计事项有关的文件、资料，检查现金、实物、有价证券，向有关单位和个人调查等方式进行审计，并取得证明材料。审计人员向有关单位和个人进行调查时，应当出示审计人员的工作证件和审计通知书副本。 第三十九条审计组对审计事项实施审计后，应当向审计机关提出审计报告。审计报告报送审计机关前，应当征求被审计单位的意见。被审计单位应当自接到审计报告之日起十日内，将其书面意见送交审计组或者审计机关。 第四十条审计机关审定审计报告，对审计事项作出评价，出具审计意见书；对违反国家规定的财政收支、财务收支行为，需要依法给予处理、处罚的，在法定职权范围内作出审计决定或者向有关主管机关提出处理、处罚意见。审计机关应当自收到审计报告之日起三十日内，将审计意见书和审计决定送达被审计单位和有关单位。审计决定自送达之日起生效。
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