案件审理程序主要包括违纪案件的审理程序、申诉案件的审理程序、备案案件的审理程序和征求意见案件的审理程序。
违纪案件的审理程序是指纪检监察机关的案件审理部门，对本级纪检监察机关调查结束的案件和下级纪检监察机关呈报审批的案件，按照审理工作的原则和要求，对案件的事实、证据、定性、处理以及办案手续方面进行审核，提出审理部门的意见，提请纪委常委会议或监察机关部（厅、局）长办公会议审查批准和执行监督的程序。
案件审理的主要程序有： 案件的审议，又称集体审议。广义的集体审议包括违纪党员所在支部的审议、案件审理部门的审议、审批机关的审议。狭义的集体审议是指承办人在对案件进行审核后，案件审理部门根据承办人的汇报，集体讨论，审核案件事实、证据、定性、处理，并提出审理部门意见的工作程序。案件审理部门集体审议的主要程序是：
1、由案件审理部门的负责同志确定召开审理会议进行集体审议的时间；
2、审理会议由案件审理部门负责同志主持，并安排专人作好集体审议记录；
3、案件承办人根据汇报提纲如实、清楚地汇报案情和审理意见；
4、参加审议的同志开展讨论，各自发表对错误事实、定性和处理意见的看法和意见；
5、会议主持人根据民主集中制的原则，综合集体审议的意见，提出案件审理部门结论性的意见。 违纪案件的批准程序是指案件审理部门对案件审理结束以后，本级纪委常委会议或监察机关部（厅、局）长办公会议根据案件的事实、证据、性质，依据党和国家的方针政策、法律法规和党纪政纪条规，对案件作出处理决定的工作程序。审理部门报送纪委常委会议或者监察机关部（厅、局）长办公会议的案件，应符合下列条件：作为处分依据的错误事实已经审查清楚；案件的证据确实、充分；审理部门已提出结论性的处理意见。
纪委常委会议或监察机关部（厅、局）长办公会议按照民主集中制的原则，对案件进行充分的讨论，对审理部门的意见作出同意、更改、否定或者需要继续调查补证的决定。审理部门按照会议的决定或要求办理必要的手续。对需要补充调查的案件，应尽快按照会议提出的问题和要求，由审理部门或检查部门、报案单位调查取证，待问题查清后，再重新提交纪委常委会议或监察机关部（厅、局）长办公会崐议审查决定。 案件审理中的执行程序是指党的组织、政府及其主管部门、纪检监察机关对违犯党纪政纪的人员，按照规定的程序将批准生效的处分决定或审查结论付诸实施的过程。
案件经纪委常委会议或监察机关部（厅、局）长办公会议作出决定后，案件审理部门按照党纪处分的批准权限和行政处分权限，应分别办理如下手续：
1、违犯党纪案件
⑴对由本级纪检机关批准的违纪案件，案件审理部门负责起草批复，经本级纪检机关的领导签发后，下发给呈报案件的单位宣布执行。
⑵由本级纪检机关直接作出处分决定的案件，由案件审理部门起草处分决定及通知，一并报本级纪检机关领导签发后，印发给下级党委、纪委。
⑶上级纪委直接做出的对犯错误党员的处分决定，可以由该级纪委直接宣布，也可以委托有关党组织宣布执行。
有关党组织做出的对犯错误党员的处分决定，呈报上级党委或纪委审批的，上级党委或纪委批准后，由呈报单位党组织宣布执行。
⑷受处分党员所在党组织，在接到上级党委、纪委对该党员处分的批复或通知后，应在一个月内向受处分党员本人宣布，将处分决定送给本人一份，并在适当范围内宣布。
⑸对需报同级党委或上级党委、纪委审批的案件，由案件审理部门负责起草案件呈报审批的请示，经本级纪检机关领导签发后，连同有关材料一并上报审批。
⑹对给予党纪处分或免予党纪处分的案件，结案后，应将处分决定、错误事实调查报告、上级批复、本人检讨及本人对处分决定的意见，按干部管理权限，抄送有关组织部门。
⑺对由本级纪委批复或直接作出处分决定的案件，其中需要向上级党委、纪委或同级党委备案的，由案件审理部门将有关材料报上级党委、纪委或同级党委备案。
2、违反政纪案件
⑴对需经本级监察机关同意的案件，案件审理部门负责起草批复，经监察机关的领导签发后，印发给呈报案件的单位宣布执行。
⑵由本级监察机关直接作出行政处分的监察决定或监察建议的案件，由案件审理部门起草处理决定书或监察建议书，印发给受处分人所在的（或归属的）有关部门宣布执行。
⑶对需报经本级政府、上级监察机关同意的案件，由案件审理部门负责起草案件呈报的请示，经本级监察机关领导签发后，连同有关材料一并上报。
⑷送达。监察决定书和监察建议书可以由监察机关直接送达有关部门、单位和人员，也可以留置送达、邮寄送达，或者委托其他监察机关、主管部门代为送达。送达监察决定书和监察建议书，必须有送达回证，由受送达人在送达回证上记明收到日期、签名或者盖章。
⑸有关部门和人员在收到监察决定或监察建议次日起30日内应当将执行、采纳的情况通报监察机关。
