大冒险V驯兽师
1998年11月21日，C兽的两位作者以这部漫画重新出发，使用动画原作本乡昭由的概念设定。
从月刊V Jump 1999年1月号开始连载。介绍了迷失在数码世界的少年·八神太一和伙伴斯路玛鲁（ZERO丸，即零零，台译为杰罗玛鲁，港译“斯路”，即“ZERO”）的胜率100%组合（名台词：八神太一[老成员之一]的1及杰罗玛鲁的00即是100%啦），打倒图谋超究极体复活的究极魔兽的故事。描写驯兽师本身以及和数码兽伙伴的友情的作品。而这里的太一和TV动画里的太一并不是同一个人，尽管他们的外表和性格很像，可以说TV中的太一是源于V-Tamer中的太一。
本作品于2003年8月21日连载结束。完结纪念时，发行了3个超究极体数码兽的限定卡片作为礼物。原作：井泽宽漫画：薮野展也 监修：本郷あきよし
次世代
人类世界的一个普通小孩龙野剑喜欢玩数码兽迷你机，他使用数码兽对战终端进入到虚拟的真实世界。第一次玩网络游戏的阿剑遇到了自己的暴龙兽。但是当他回到现实世界的时候，他被真正的古加兽攻击。在这时，他的数码兽迷你机开始发光了……
原作：浜崎达也漫画：冈野刚 原案：本郷あきよし
合体战争
一天，工藤大器偶然听到了神秘声音的呼唤，而成为了指挥官，与朋友们一起来到了数码世界中，在那里认识了众多的数码兽同伴。然而他们将要担负起拯救数码兽世界的重任。为了防止企图称霸数码世界的巴古拉军而努力的收集著各个领域的水晶，令他们意想不到的是在数码世界中除了他们外竟然还有别的人类在数码世界中活跃着…
漫画：中岛谕宇树原案：本郷あきよし
数码兽世界：复原 编码
继续上一作的故事，当大河和“猫咪驯兽师”再度对战时，却收到一封神秘邮件。主人公们费尽心思打开邮件之后却被带了数码世界。在那里等待他们的是…本作单行本收录《数码兽世界：复元》
漫画：藤野耕平原案：本郷あきよし原作：万代南梦宫游戏 数码兽c'mon
数码系列最早的漫画，在97年夏，由薮野展也（やぶのてんや）及井泽宽（井沢ひろし）所作的漫画，刊登在赤マルJump 1997 SUMMER上，并收录于VT01的单行本附录。
加门健太郎在小时候，曾经被困在因为随地乱丢烟头而形成的火场，被一只小狗救出，同时在手肘处留下了伤口。因此健太郎并不喜欢小动物，在班级风行数码兽的时候，他却对数码兽毫无兴趣。
然而他的同学阿允却觉得这样的健太郎不是真正的健太郎，建议他去养一只数码兽，最后阿允用了一些小手段，让健太郎也拥有了一只数码兽。这个时候城崎电子工学研究所的继承人——城崎慎一郎出现了，他拥有强大的死亡兽，以击败其他数码兽并销毁其暴龙机为乐，阿允的数码兽也未能逃脱。
健太郎见了，决定帮助阿允。经历了一场大战后，健太郎的数码兽终于打倒了死亡兽，同时也令他解开了心结，高高兴兴地饲养起数码兽。
漫画：井泽宽、薮野展也、原案：本郷あきよし
数码兽世界：复原
『数码兽』是一款由GIGO公司提供的，通过育成“数码兽”参加竞技，来争夺排名的在线游戏。主人公大河就是其中一名热衷于这款游戏的玩家。某日，大河和朋友尼克在对战之时网络却出现异常,当一切归于平静，大河却收到来自排名第一的“猫咪驯兽师”的挑战书，正当他们激战时，出现在他们面前的是…… 在《数码兽世界：复原 编码》的漫画单行本第1巻中作为第1、2话收录。
数码兽传说 网络侦探
《数码兽传说 网络侦探》（Digimon Story: Cyber Sleuth，デジモンストーリーサイバースルゥース ）（原案：本乡昭由、漫画：フクダイクミ、原作：万代南梦宫游戏），是又一作与游戏联动的短篇漫画，刊登于2015年4月号VJump杂志。 编年史
2004年BANDAI为了推销他们的新对打机而发表的漫画，仅随对打机发售，有一套卡片游戏的说明纸上请到这部漫画的主角来作教学。
和平之中,暗藏危机.数码兽的过度增殖,造成数据空前膨胀,终于引发了普遍性数码世界危机.鉴于数码世界可用率越来越低的现状,掌管总信息的主系统世界树(Yggdrasil)创建了新数码世界,并将一部分选中的数码兽转移过去.对于剩余的数码兽以及旧数码世界,则用X程序予以彻底毁灭.
由于一个偶然的原因,人类少年堂本光太误入了新数码世界的Belldandy层,并与试验体多路兽邂逅,开始了他们的冒险,并结识了战斗暴龙兽X,钢铁加鲁鲁X等一批从旧世界逃来的带有X抗体的不速之客.Belldandy层的最高执法者奥米加兽是一个冷酷无情的皇骑,对一切不符合秩序的事物都要斩尽杀绝;而另一执法者红莲骑士兽则有很强的怜悯之心.
go！go！数码兽
デジくん(数码君)： 小学4年级，喜爱数码兽的热血少年。和妹妹モンちゃん一样以成为Digimon King为目的。现在的目标是比自己大一年的数码兽师匠！数码兽是飞龙兽。C'mon的加门健太郎估计就是以此为原型流过去的人设了。モンちゃん(小萌/萌酱?图中黄发妹子)： デジくん的妹妹，小学3年级。养育数码兽是因为觉得它们很可爱。お兄ちゃんが大好き(←全系列首位兄控)。师匠()： 被认为是培养着最强数码兽的的达人，小学5年级。很酷也和时尚，但是每当进行数码兽对战就会火热地燃烧斗志。是デジくん的前辈。数码兽是暴龙兽。还记得C'mon的反派以及VT里面的谜之银发同学吗？
这里主要收录日本官方授权香港方面发行的漫画
超进化--龙魂战记
地狱死神兽令数码核心复活，变成极恶暴龙「破灭皇龙兽」！奥米加兽也不是它的对手！没有龙魂下催谷力量，黄金剑神兽生命终结？更甚的是，数码世界末世降临！
激斗，数码暴龙
1999年在香港《CO-CO》连载的漫画
以及根据tv动画改编的漫画。1至4部由余远煌先生重新绘制，5、6为疑是TV截图版
