本田飞度发动机抖动的原因有以下几点：
1. 发动机积碳严重：这是造成汽车抖动最常见的原因。当发动机内部的积碳过多时，冷启动喷油头喷出的汽油会被积碳大量吸收，导致冷启动的混合气过稀，使得启动困难。只有等到积碳吸收的汽油饱和，才容易着车，着车后吸附在积碳上的汽油又会被发动机的真空吸力吸入汽缸内燃烧，又使混合气变浓，发动机的可燃混合气时稀时浓，造成冷启动后怠速抖动。气温越低，冷启动所需要的油量越大，积碳的存在就越会影响冷启动的顺利与否。
2. 发动机缺缸：发动机有一个或以上的气缸没有正常工作时，表现为汽车排出的废气气流有明显的间歇，同时排气管抖动厉害，能够明显感觉到发动机的抖动，有时会伴随着突突的声音。这种多半和点火线圈故障有关。