萝岗区行政区划在2006年3月6日进行了调整，由广州市民政局转发广东省民政厅的批复决定，设立了九龙镇和永和街道办事处。调整后的萝岗区包括1个镇（九龙镇）和5个街道办事处（永和、夏港、萝岗、东区、联和）。
九龙镇原属广州市白云区钟落潭镇和增城市中新镇的部分区域，管辖九佛、穗北2个居委会和14个村委会，以及镇龙居委会和14个村委会，总面积175.11平方公里，户籍人口6.8万人，镇政府位于九公路978号。永和街道办事处作为区政府派出机关，负责增城市新塘镇部分区域，总面积32.96平方公里，户籍人口2.3万人，街道办事处驻地为永顺大道中1号。
夏港街道成立于1989年，随着广州经济技术开发区的成立而设立。2003年划入广州开发区管理，位于开发区西区，总面积14.54平方公里，人口10.5万，包括6个社区，是集政治、工业、商业等多种功能于一体的街区。
东区街道面积54平方公里，与增城市新塘镇相邻，下辖4个社区居委会，是广州经济技术开发区的一部分，以高效开发模式进行建设。联和街道是区政府派出机构，负责管理62.18平方公里区域，人口9.69万，包括黄陂等6个社区和科学萝岗香雪公园城。
萝岗街道辖区总面积80.1平方公里，人口3.5万人，下辖8个社区，如萝岗社区、萝峰社区等，分别负责各自的区域管理。
萝岗区位于中国第三大城市广州市的东部，与白云区、天河区、黄埔区三个行政区相邻，是广州城市发展“东进”战略，发挥开发区的辐射带动作用，统筹城乡发展，2005年 4月，经国务院批准，在开发区基础上，整合周边农村地区，设立萝岗区，管辖面积393.22平方公里。下辖夏港街、萝岗街、东区街、联和街、永和街、九龙镇5街1镇，共30个居委会、28个村委会。截至2009年12月31日，全区常住人口23.16万人，其中户籍人口18.27万人。流动人口30.1万人。全区共有生产性企业632家，其中规模以上394家。