用肉眼鉴定仍然确定不了的矿物，就需要借助其他专门方法。矿物的鉴定和研究方法很多，应根据研究目的，按照有效、准确和快速的原则进行选择。
鉴定和研究矿物的专门方法包括:
(1)检测矿物化学成分的方法:简易化学试验、光谱分析、原子吸收光谱分析、激光光谱分析，X射线荧光光谱分析、极谱分析、化学分析和电子探针分析;
(2)通过测定矿物某种物性或晶体结构数据从而可定出矿物种属的方法:密度测定、热分析、显微镜观察、电子显微镜观察、X射线分析、红外光谱分析、穆斯堡尔效应;
(3)研究矿物形貌的方法:测角法、电子显微镜观察;
(4)其他专门方法:包裹体研究、稳定同位素研究等。