巡抚：即布政使,省级行政区域的最高长官,相当于省长。不过，要比现在的省长官职大一点，除了要抓经济和人们生活哇，还能掌握一些部队。总督直接掌管的部队称为督标，相应的巡抚的部队称为抚标，这部分部队由总督或巡抚直接调配，但调动部队应通知中央的兵部或军机处，否则可能遭到弹劾。
总督：通常指一个国家的某片相对自主的区域中实际或名义上的最高行政长官。清朝时对统辖一省或数省行政、经济及军事的长官称为“总督”， 官阶为正二品，但可通过兼兵部尚书衔高配至从一品。巡抚巡视各地的军政、民政大臣，以“巡行天下，抚军按民”而名。
总督和巡抚：
首先，我们从级别上来看，总督一般是正二品，但巡抚却一般是从二品。当然，总督和巡抚都还有另加衔，但一般情况下，即使是有另加衔，也是总督经常另加“尚书衔”，兼都察院右都御史；而巡抚呢？却是经常另加“侍郎衔”，兼都察院右副都御史。
所以，从中我们就不难看出，总督要比巡抚级别高。并且，都察院这个机构也就相当于咱们现在的中纪委，而其最高长官一般都是“右都御史”，而不是“右副都御史”。
其次，巡抚一般仅仅负责一个省的行政事务，所以，它也仅仅类似于咱们现在的“省委书记兼省长”，顶多再担负有一个“卫戍区总司令”的角色。所以，如果有读过《胡雪岩》的看官，就一定会了解，这本书里面的浙江巡抚王有龄之所以自焚，就是因为其作为一省之封疆大吏，负有着“卫戍”之责，即：“地在人在，地失人亡”。
所以，他选择了自杀。而总督呢？当时，尽管全国有23个省，但总督却也就区区八名，即使有的不是管辖数省的，也至少会管理一个大省。并且，如果从军事实力的角度来看，人家总督一般还会兼任当地的大军区司令员。显然，这样一来，相信大家就已经很明白了，一个是卫戍区司令员，一个却是大军区司令员，根本就不在一个台阶上。
再次，督抚虽然没有名义上的隶属关系，但是，如果一旦出现督抚同城的情况，巡抚就一般会很尴尬，不得不处处小心。所以，相对而言，当时，也只有河南巡抚因为它上无总督，而被誉为巡抚当中的第一肥缺。
当然，由于总督和巡抚无论怎么说，都是直接对皇帝负责的，并直接听命于皇帝。所以，一般情况下，二者如果碰面也都会江水不犯河水，各管各的事情，即：总督侧重军事，巡抚侧重民政。而当时的八大总督就分别是：直隶、两江、闽浙、两湖、陕甘、四川、两广、云贵总督。