生肉或半生肉
烹调不到家，肉类还没熟透怎么办？不少人选择将其放到微波炉里“翻叮”一下，但这样就错了！因为半熟的肉类中，细菌仍然在不断生长，用微波炉虽然能把其加热至成熟，但由于微波炉加热时间短，并不能把细菌全数杀死，残留的细菌就会对健康造成危害。冰冻肉类食品须先在微波炉中解冻，然后再加热为熟食。
液体食品
睡前“叮”杯热牛奶、冷汤加热，如果使用微波炉则需要注意。因为液体在微波炉加热过程中，有可能会突然沸腾并爆开，高温液体四处溅，很有可能烫伤人，因此在加热液体食品时，不要用高温加热太久，尽可能不要使用微波炉加热液体食品。
有“衣”食物
诸如鸡蛋、鹌鹑、脆皮肠、鱼子等外有“盔甲”或有膜的食物，加热过程中会产生大量蒸汽，有可能出现爆炸现象，应该避免直接放入完整的鸡蛋，去掉外壳，或在膜上割一刀、戳几个洞，让蒸汽散发。若是鸡蛋液、鸡蛋羹此类食物，也要注意在容器上加盖留孔，以免鸡蛋羹可能炸得整个内壁都是。
芦笋。新鲜芦笋富含包括维生素C在内的多种抗氧化营养素。挪威《斯堪的纳维亚农业学报》刊登一项新研究发现，微波炉加热会导致芦笋中维生素流失。因为维生素C和B族维生素属于水溶性维生素，稳定性更差，遇水、遇热、遇光容易遭到破坏。
母乳。很多妈妈将母乳挤入奶瓶存入冰箱，使用时再用微波炉加热，这容易导致其中重要营养素减少。美国《儿科》杂志刊登一项研究发现，微波炉加热的母乳中含大肠杆菌的危险比其他方式加热高18倍。
西兰花。西兰花是最常见的微波食物。然而，美国《食品和农业的科学杂志》刊登一项研究发现，用微波炉烹饪西兰花会导致其中抗氧化成分减少97%。而用燃气灶烹饪西兰花只会导致其中抗氧化物减少11%。
干辣椒。干辣椒中的辣椒素具有挥发性和不稳定性，微波加热很容易着火。微波加热过程中，干辣椒散发出的化学物质会刺激眼睛和嗓子。
冷冻水果。美国《生物电磁学》杂志刊登一项研究发现，用微波炉解冻冷冻水果容易导致有益健康的葡萄糖苷和半乳糖苷转变为致癌物质。冷冻水果的最好解冻方法是常温下自然解冻。
大蒜。美国《营养学杂志》刊登一项研究发现，微波炉加热1分钟就会摧毁大蒜中的活性硫烯丙基化合物，使之失去应有的抗癌作用。大部分的蔬菜尤其是绿叶菜如果用微波炉加热，都有可能