公司从其他单位开过来的发票，税务局向出票单位发协查函的原因是“四小票”系统提示的比对异常发票，这类发票不一定全是有问题发票。
有些是发票录入时时间、金额、代码等等误输，也有存根联进入系统，抵扣联未进入系统，也有虚开发票比对不符的。这种情况，可以一要求税务部门与对方税务部门沟通，如果纯粹是录入错误，争取简化处理，二是根据税务部门要求对方税务机关重新发函。开具增值税专用发票的注意事项：
1、项目填写齐全，全部联次一次填开；
2、字迹清楚，不得涂改；
3、发票联和抵扣联加盖单位发票专用章，不得加盖其他财务印章；
4、开票时，发票的抬头要与企业名称的全称一致；
5、报销要及时，发票时间尽量不要跨年，否则不能税前扣除；
6、开具增值税发票时，发票内容应按照实际销售情况如实开具。
《中华人民共和国发票管理办法》第七条 增值税专用发票由国务院税务主管部门确定的企业印制；其他发票，按照国务院税务主管部门的规定，由省、自治区、直辖市税务机关确定的企业印制。禁止私自印制、伪造、变造发票。
第十五条 需要领购发票的单位和个人，应当持税务登记证件、经办人身份证明、按照国务院税务主管部门规定式样制作的发票专用章的印模，向主管税务机关办理发票领购手续。主管税务机关根据领购单位和个人的经营范围和规模，确认领购发票的种类、数量以及领购方式，在5个工作日内发给发票领购簿。
单位和个人领购发票时，应当按照税务机关的规定报告发票使用情况，税务机关应当按照规定进行查验。
第十九条 销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票；特殊情况下，由付款方向收款方开具发票。
第二十二条 开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。
任何单位和个人不得有下列虚开发票行为：
（一）为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（二）让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（三）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。
第二十四条 任何单位和个人应当按照发票管理规定使用发票，不得有下列行为：
（一）转借、转让、介绍他人转让发票、发票监制章和发票防伪专用品；
（二）知道或者应当知道是私自印制、伪造、变造、非法取得或者废止的发票而受让、开具、存放、携带、邮寄、运输；
（三）拆本使用发票；
（四）扩大发票使用范围；
（五）以其他凭证代替发票使用。
税务机关应当提供查询发票真伪的便捷渠道。
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