文山市坐落在滇东南的偏西地带，东经103°43′至104°27′，北纬23°16′至23°44′之间，处于北回归线两侧，与砚山、马关、西畴和红河州的蒙自、屏边相邻。其地理位置决定了其在云南的特殊地位，既是政治、经济、文化中心，又拥有地方民族特色，是滇东南重要的城市之一，也是中国三七绿色产业的中心。
城市规划方面，文山市的城市规划区包括开化镇、马塘镇等，总面积870平方公里，其中中心区规划为66平方公里。规划期限涵盖2006年至2050年，分为近期、远期和远景阶段。城市发展方向为“北拓南展”，近期向北扩展，中远期向南发展。城市布局独特，以盘龙河为核心，开化路和文华路—花桥路为主轴，划分为卧龙片、中心片和花桥片。
交通方面，文山市是滇东南的交通枢纽，与昆明、南宁、天保、河口等地有便捷的公路和铁路连接。323国道近在咫尺，文山普者黑机场距离仅23公里，是云南省出海最近的商贸中心，正在建设中的高等级公路和铁路将进一步强化其立体交通网络。
地貌上，文山市属于滇东南岩溶山原区，山势起伏，峡谷众多，薄竹山为滇东南第一高峰，与最低谷的果峡谷形成鲜明的海拔差异，体现了丰富的地形地貌和多样的气候条件。气候特点为四季分明，年均气温适中，日照时间长，降雨量充沛，全年无霜期长，为当地农业和生态发展提供了适宜的条件。
文山县位于云南省东南部，文山壮族苗族自治州西部。县境东西最宽63公里，南北最长66公里，总面积2972平方公里。大部分地区属西风带中亚热带季风气候。海拔最高2991.2米，最低618米。全县人口419018人，其中少数民族占54%，全县特产名贵药材三七，产量质量均属全国之冠。文山县是多民族杂居县。共有12个少数民族，以壮、彝、苗居多。由于民族众多，展现出多姿多彩的民族文化、风俗。全县人口分布明显：城镇人口较集中，坝区、半山区、高寒山区相对较稀少。