无创DNA亲子鉴定的准确率一般也是否定的100%排除，肯定的亲权指数大于9999的，即亲权概率大于99.99%。排除所有所有特殊因素如：近亲、外源干扰，其准确率就是100%的。
累计亲权指数是亲子鉴定的一项比不可少的控制指标。常规亲子鉴定得到留样者的DNA数据，原后计算每个基因座位点的父权指数，所有位点的父权指数相乘得到累计父权指数，原后再由父权指数得到亲权概率和非父排除率。无创DNA亲子鉴定同样也是需要根据检测出的位点来计算出累计父权指数。当父权指数为9999时，可以得到父权概率为99.99%，非父排除率为0.9999，达到这些指数就是更极强有力支持存在亲子关系。结论描述即为支持或不排除存在亲子关系。
若是否定的，即非亲子关系时，会有很多个位点不符合遗传规律的。当然如果得不到相应的DNA数据或是相应的DNA数据量时，是无法判断的。
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