当菌丝体与寄主细胞壁或原生质接触后，营养物质因渗透压的关系进人菌丝体内。有些真菌如活体营养生物侵人寄主后，菌丝体在寄主细胞内形成吸收 养分的特殊机构称为吸器。吸器的形状不一，因种类不同而异，如白粉菌吸器为掌状、霜霉菌为丝状、镑菌为指状、白锈菌为小球状。有些真菌的菌丝体生长到 一定阶段，可形成疏松或紧密的组织体。苗丝组织体主要有菌核、子座和菌索等。 菌核是由菌丝紧密交织而成的休眠体，内层是疏丝组织，外层是拟薄壁组织，表皮细胞壁厚、色深、较坚硬。菌核的功能主要是抵抗不良环境。但当条件适宜 时,菌核能萌发产生新的营养菌丝或从 上面形成新的繁殖体。菌核的形状和大 小差异较大，通常似绿豆、鼠粪或不规则状。子座是由菌丝在寄主表面或表皮下父织形成的一种塾状结构，有时与寄主 组织结合而成。子座的主要功能是形成 产生孢子的机构，但也有度过不良环境的作用。菌索是由菌丝体平行组成的长 条形绳索状结构，外形与植物的根有些相似，所以也称根状菌索。菌索可抵抗 不良环境，也有助于菌体在基质上蔓延。有些真菌菌丝或孢子中的某些细胞膨大 变圆、原生质浓缩、细胞壁加厚而形成厚垣孢子。它能抵抗不良环境，待条件适宜时，再萌发成菌丝。
真菌在自然界中分布广泛，类群庞大，约有十几万种，形态差异极大。菌体小至显微镜下才能看见的单细胞酵母菌，大至肉眼可见的分化程度较高的灵芝等蕈菌的子实体。生殖方式为无性或有性，同宗或异宗配合。
真菌是一类低等真核微生物，主要有4个特点：①有边缘清楚的核膜包围着细胞核，而且在一个细胞内有时可以包含多个核，其他真核生物很少出现这种现象；②不含叶绿素，不能进行光合作用，营养方式为异养吸收型，即通过细胞表面自周围环境中吸收可溶性营养物质，不同于植物(光合作用)和动物(吞噬作用)；③以产生大量无性和有性孢子进行繁殖；④除酵母菌为单细胞外，一般具有发达分枝的菌丝体。
真菌与人类的关系非常密切。它们可以作为食品的来源，为人类提供美味食品和蛋白质、维生素等资源，同时还可为人类提供真菌多糖、低聚糖等提高免疫力、抗肿瘤的生物活性物质。有些真菌还可产生抗生素、酒精、有机酸、酶制剂、脂肪、促生长素等。用作名贵药材的灵芝、茯苓等也是真菌的菌体。真菌还可以将环境中的各种有机物降解为简单的复合物和无机小分子，在自然界的物质转化中起着不容忽视的作用。另外，真菌还是进行基础生物学研究的重要研究工具。
但是真菌也有对人类有害的一面，如许多真菌可引起人畜的疾病、植物病害、导致工业原料及农产品的霉变、食品和粮食发霉，甚至在食品和粮食中产生毒素，给人类带来了极大的危害和损失。
有些真菌会使一整圈的草枯死，其它真菌则会使草长得更好，使圈内的草长得比周围的更加鲜绿繁茂，在吸取了腐烂的有机物，比如枯死的树根后，尤其如此。大量菌丝交织成绒毛状、絮状或网状等，称为菌丝体。菌丝体常呈白色、褐色、灰色，或呈鲜艳的颜色，有的可产生色素使基质着色。真菌多在土壤中生长，孢子飞扬于空气中，被吸入到肺部引起肺真菌病（外源性）。有 些真菌为寄生菌，当机体免疫力下降时可引起感染。体内其他部位真菌感染亦可循淋巴或 血液到肺部，为继发性肺真菌病。
