鹿茸不宜长时间放在冰箱里,药材放入冰箱内，和其他食物混放时间一长，不但各种细菌容易侵入药材内，而且容易受潮，破坏了药材的药性，所以对一些贵重的药材，如人参、鹿茸、天麻、党参等，若需长期保存，可放在一个干净的玻璃瓶内，然后投入适量用文火炒至暗黄的糯米，待晾凉后放入，将瓶盖封严，搁置在阴凉通风处。
鹿茸的保存要特别小心，首要的是要注意空气湿度问题，如果空气太潮湿，鹿茸就容易发霉，接着就会生虫。所以首先要把鹿茸放在一个通风的地方，然后用布包一些花椒，放在鹿茸旁边，这样就不会招虫了。如果保存得当，三五年内，鹿茸的药效是不会发生变化的。
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