用药过程中，有时会出现明显个体差异:一种是耐受性，一种是耐药性。前者是针对人体而言；后者是针对病原体而言。一字之差，意义不尽相同。
所谓耐受性是指患者对某种药物的反应性很低，按多数人已能见效的剂量服用却不能引起反应，甚至要加大到中毒剂量才能出现疗效，表明对该药具有很强的耐受能力。耐受性除极少数与先天遗传有关外，大多数为后天获得，临床意义也较大。突出的例子，如有人睡前服常规剂量的安眠药，即起催眠作用；但对一位长期服用安眠药的人，则对药物的敏感性逐渐降低，药效也随之减弱，需要不断增加剂量才能获得原有疗效。久之，不仅产生耐受性，还会成瘾。某些镇痛药、吗啡类、激素类、乙醇也有类似情况。产生耐受性的机理，主要是机体内神经组织的反应细胞对该药逐渐出现适应能力所致，其次与个体肝细胞微粒体中的药酶多少有关，即某种药物进入体内后，肝脏的药酶分泌明显增多，以致对该药破坏加速，使其作用减退，导致耐受性形成。预防耐受性的方法，主要是用药时间宜短不宜长，可交替使用疗效相同的其他药物。
耐药性又称抗药性，是指某种病原体，如细菌，由于反复接触某类抗菌药物后，反应性不断减退，以致最后细菌对该类药物产生抵抗，而不再被抑制或杀灭。有时病原体还能对其他结肠和作用类似的抗菌也产生耐药性，称为交叉耐药性，这已成为临床上应用抗菌药物治疗感染疾病的一个难题。预防耐药性关键在于平时不要滥用抗菌药，有条件最好先做药敏试验，然后下药；使用抗菌药时剂量要足够，疗程要适当；也可选择疗效相似的同类抗菌药交替使用。