自治区行政区包括13个地州、17个市、70个县、844个乡镇，其中132个镇、 670个乡和42个民族乡13个地州中有5个自治州：伊犁哈萨克自治州、博尔塔拉蒙古自治州、昌吉回族自治州、巴音郭楞蒙古自治州、克孜勒苏柯尔克孜自 治州；8个地区：哈密地区、吐鲁番地区、阿克苏地区、喀什地区、和田地区、伊犁地区、塔城地区和阿勒泰地区；17个市中有3个自治区直辖市（首府乌鲁木齐市、克拉玛依市和石河子市）；8个地辖市（哈密市、吐鲁番市、阿克苏市、喀什市、和田市、伊宁市、塔城市和阿勒泰市）；6个州辖市（奎屯市、博乐市、昌吉市、阜康市、库尔勒市和阿图什市）；
70个县中有6个民族自治 县（察布查尔锡伯自治县、和布克赛尔蒙古自治县、木垒哈萨克自治县、巴里坤哈萨克自治县、焉耆回族自治县、塔什库尔干塔吉克自治县
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