制定《烟草专卖许可证管理办法》的法定依据：
《烟草专卖许可证管理办法》（规章）第一条 为了规范烟草专卖许可证管理，保护公民、法人和其他组织的合法权益，根据《中华人民共和国烟草专卖法》、《中华人民共和国行政许可法》、《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》及相关法律、行政法规的规定，制定本办法。
《中华人民共和国烟草专卖法》（法律）第三条 国家对烟草专卖品的生产、销售、进出口依法实行专卖管理，并实行烟草专卖许可证制度。
《中华人民共和国行政许可法》（法律）第八条第二款 行政许可所依据的法律、法规、规章修改或者废止，或者准予行政许可所依据的客观情况发生重大变化的，为了公共利益的需要，行政机关可以依法变更或者撤回已经生效的行政许可。
《烟草专卖许可证管理办法》（规章）第五条第二款烟草专卖许可证所依据的法律、法规、规章修改、废止，或者办理烟草专卖许可证所依据的客观情况发生重大变化的，为了公共利益的需要，烟草专卖行政主管部门可以依法变更或者撤回已经生效的烟草专卖许可证。
《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》（行政法规）第六条 从事烟草专卖品的生产、批发、零售业务，以及经营烟草专卖品进出口业务和经营外国烟草制品购销业务的，必须依照《烟草专卖法》和本条例的规定，申请领取烟草专卖许可证。
《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》（行政法规）第十六条第二款 烟草专卖许可证的具体管理办法，由国务院烟草专卖行政主管部门根据本条例的规定制定。
根据上述法律规定要废除《烟草专卖许可证管理办法》，除非具备有以下情形：
1、国家将废除烟草专卖管理制度；
2、国家将废除烟草专卖许可证制度；
3、国家继续使用烟草专卖管理和许可证管理制度。将进一步完善烟草专卖许可证制度，废除现适用的《烟草专卖许可证管理办法》之后，颁布新的《烟草专卖许可证管理办法》。
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