由于菊苣黄斑驳病毒在菊苣上引起特殊症状，易同自然侵染菊苣的其他病毒区别。侵染菊苣的其他球状病毒如芜菁黄花叶病毒（Kaper.&.Alting.Siberg，1969）、花生矮化病毒（Western.strain）.（Mink，1972）、葡萄铬黄花叶病毒、萝卜花叶病毒和意大利菊芋潜隐病毒（A.Quacquarelli，未发表），经冻融病毒蛋白和RNA能完整分离，而菊苣黄斑驳病毒在冻后，只释放完整的RNA，蛋白外壳则降解。菊苣黄斑驳病毒的少数离心制剂同含卫星RNA的烟草环斑病毒（Schneider，Hull.&.Markham，1972）的制剂相似，但两者无血清关系。至此，有足够理由，将菊苣黄斑驳病毒归入线虫传多面体病毒属。