新开办的企业注册资本100万，应缴印花税：
按企业注册资本100万元*（税率）0.05%=应缴纳的印花税500元。
加上其他账簿按每件缴纳5元印花税。
《印花税暂行条例》的相关规定：
我国印花税采取正列举形式，只对《印花税暂行条例》列举的凭证征收，没有列举的凭证不征税。
列举的凭证分为五类，即经济合同、产权转移书据、营业账簿、权利、许可证照和经财政部门确认的其他凭证。
印花税税目中的营业账簿归属于财务会计账簿，是按照财务会计制度的要求设置的，反映生产经营活动的账册。
按照营业账簿反映的内容不同，在税目中分为记载资金的账簿（简称资金账簿）和其他营业账簿两类。
拓展内容：
印花税：
是对经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。因采用在应税凭证上粘贴印花税票作为完税的标志而得名。
印花税的纳税人包括在中国境内书立、领受规定的经济凭证的企业、行政单位、事业单位、军事单位、社会团体、其他单位、个体工商户和其他个人。
印花税的名称来自于中国。1889年（光绪15年）总理海军事务大臣奕_奏请清政府开办用某种图案表示完税的税收制度。可能由于翻译原因所至，将其称为印花税。
在中华人民共和国境内书立、领受《中华人民共和国》所列举凭证的单位和个人，都是印花税的纳税义务人，应当按照规定缴纳印花税。