创业板指数的样本股选择主要基于特定条件和流程。首先，入选范围限于在深交所上市交易的A股，且需满足一定的上市交易期限，通常为三个月，但对于流通市值排名在样本数10%内的股票，此限制可适当放宽。公司需在过去一年内无重大违规行为，财务报告无重大问题，且经营稳定，无重大亏损记录，且考察期内股价表现正常，无异常波动。
选取方法是通过计算股票的流通市值比重和平均成交金额比重，以2：1的权重进行加权平均，以此对创业板股票进行排序。在考虑公司治理结构和经营状况后，采用缓冲区技术确定最终的100只成份股。初始成份股为发布日已纳入深证综合指数的全部创业板股票。
在样本数量未满100只时，新上市的创业板股票会在上市后第十一个交易日纳入指数计算。一旦样本股达到100只，将锁定数量，此后调整时会剔除部分不符合条件的股票。调整规则是每季度进行一次，通常在每年1月、4月、7月和10月的第一个交易日实施，调整方案会在实施日前一月的第二个完整交易周的第一个交易日公布。
调整时，入围股票按照加权比值进行综合排名，非原成份股中排名在样本数70%以内的将按顺序入选，而原成份股排名在样本数130%范围内的则优先保留。每次调整样本股数量不超过总数的10%。这样的调整机制旨在保持指数的代表性与市场敏感度。
创业板指数，也称为“加权平均指数”，就是以起始日为一个基准点，按照创业板所有股票的流通市值，一个一个计算当天的股价，再加权平均，与开板之日的“基准点”比较。