将道德教育作为专门的学科课程进行设置的理由如下：
道德教育作为学科具有独立的理论与方法：在进行道德教育时需要有一定的理论与方法，将道德教育作为专门的学科课程设置可以使教师系统、全面、科学地了解道德教育的理论和方法，从而更好地进行道德教育。
培养学生的道德素质：道德教育以道德素质的培养为核心目标，通过课程设置，可以提供学生系统、全面的道德知识结构，引导学生树立正确的价值观，完善自身的道德品质，从而让学生更好地实现人格全面发展。
强化道德教育的针对性和系统性：将道德教育作为专门的学科课程进行设置，可以加强对道德教育的针对性和系统性，让学习者能够深刻体验道德教育的内在价值，进而达到深入根本，长期有效的道德教育目标。
加强社会基层道德建设：学生的道德水平直接关系到社会基层道德的质量，因此强化道德教育特别是将道德教育作为专门的学科课程进行设置，可以促进社会道德的建设，提升社会道德事业的发展。
综上所述，将道德教育作为专门的学科课程进行设置非常有必要，它有助于教师完善道德教育理论与方法，培养全面发展的人，拓展学生的道德知识，达到深入根本、长期有效的道德建设目标，促进社会道德建设和提升社会道德事业的发展。