药品注册申请不包括：改变商品名的申请、非处方药申请、医疗机构制剂申请。
一、药品注册申请
药品注册申请包括新药申请、仿制药申请、进口药品申请及其补充申请和再注册申请。
1、新药申请：新药申请指未曾在中国境内上市销售的药品的注册申请。对已上市药品改变剂型、改变给药途径、增加新适应症的药品注册按照新药申请的程序申报。
2、仿制药申请：仿制药申请是指生产国家食品药品监督管理局已批准上市的已有国家标准的药品的注册申请；但是生物制品按照新药申请的程序申报。
3、进口药品申请：进口药品申请指境外生产的药品在中国境内上市销售的注册申请。
4、补充申请：补充申请是指新药申请、仿制药申请或者进口药品申请经批准后，改变、增加或者取消原批准事项或者内容的注册申请。
5、再注册申请：再注册申请是指药品批准证明文件有效期满后申请人拟继续生产或者进口该药品的注册申请。
二、药品注册申请概念
药品注册申请是指将一种新的或者现有的化学药品或生物药品，提交到食品药品监督管理部门进行相应的审批和注册的申请过程。药品注册申请的内容包括但不限于药品的研发信息、临床试验数据、质量控制要求、药品说明书等内容，旨在证明该药品的安全性、有效性和质量可控性。
三、注册程序
1、由全体股东指定的代表或者共同委托的代理人向公司登记机关申请名称预先核准，凭名称预先核准通知书、药师资格证书到药监局办理药品经营许可证，凭名称预先核准通知书到银行开户，然后到会计师事务所进行验资，由会计师事务所出具验资报告后；
2、带上全体股东指定代表或者共同委托代理人的证明、企业名称预先核准通知书、验资报告、股东会决议（选举法宝代表人的决议）、股东身份证、公司章程、许可证、营业场所证明材料、房屋租赁协议到工商局办理注册登记。然后到税务局办理税务登记证，到质监局办理机构代码证。