农村自建房办理房产证的方法：1、建房户向村委会提出建房申请；2、村委会审核同意，签字盖章；3、向乡建办提出申请；4、乡建办工作人员实地踏看，同意建房；5、到乡建办领取房屋建设申请表；6、经乡建办签字同意；7、乡主管领导签字盖章，核实同意；8、交县规划建设局审批(县行政服务中心)；9、建房户领取产权证。
【法律依据】
《房屋登记办法》第82条依法利用宅基地建造的村民住房和依法利用其他集体所有建设用地建造的房屋，可以依照本办法的规定申请房屋登记。法律、法规对集体土地范围内房屋登记另有规定的，从其规定。第83条，因合法建造房屋申请房屋所有权初始登记的，应当提交下列材料：（一）登记申请书；（二）申请人的身份证明；（三）宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；（四）申请登记房屋符合城乡规划的证明；（五）房屋测绘报告或者村民住房平面图；（六）其他必要材料。申请村民住房所有权初始登记的，还应当提交申请人属于房屋所在地农村集体经济组织成员的证明。农村集体经济组织申请房屋所有权初始登记的，还应当提交经村民会议同意或者由村民会议授权经村民代表会议同意的证明材料。第84条，办理村民住房所有权初始登记、农村集体经济组织所有房屋所有权初始登记，房屋登记机构受理登记申请后，应当将申请登记事项在房屋所在地农村集体经济组织内进行公告。经公告无异议或者异议不成立的，方可予以登记。
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