1、目的不同
刷机主要是为解决老版本软件中的BUG推出的补丁程序，一般是解决反应速度慢、音量小、短信模版、死机、显示亮度等等；还有些是为了增强原机型的功能，比如增加数码变焦、像框种类、图象的编辑能力等等，在不改变手机硬件的情况下提升其功能。
恢复出厂设置主要是为了指的是把手机里的通讯录、短信、自己安装的软件等都删除，把手机恢复到刚买到时的状态。
2、方式不同
刷机就是给手机重装系统，可以是刷入官方的系统，也可以是刷入经过修改过的系统。而恢复出厂设置直接在手机设置页面即可操作实现。
3、删除范围不同
刷机不仅将所有的设置，所有的用户数据，所有的第三方软件全部删除掉，就连系统本身也被删，然后换上新的手机系统，就像给电脑重装系统一样。
恢复出厂设置是恢复到手机出厂时的界面，如开始界面、待机方式、操作快捷键、定时提醒等功能恢复但不会删除存储的数据。
参考资料来源：百度百科-刷机
参考资料来源：百度百科-出厂设置
手机刷机与恢复出厂设置二者本质不同，具体区别如下：
1.定义不同：
①刷机就是通过一些手段来增加、删除或者替换手机中的系统文件，这些文件可以是开机动画、可以是谷歌服务、可以是内核、可以是基带，当然了，也可以是整个系统。
②恢复出厂设置是把手机恢复到你刚买到手时候的状态，手机里的软件设置等都恢复到出厂时候的，后来设置都取消。但是内存卡里的东西还在。
2.删除范围不同：
①刷机不仅将所有的设置，所有的用户数据，所有的第三方软件全部删除掉，就连系统本身也被删，然后换上新的手机系统，就像给电脑重装系统一样。
②恢复出厂设置是讲手机恢复到手机出厂时的界面，如开始界面、待机方式、操作快捷键、定时提醒等功能恢复但不会删除存储的数据。恢复出厂设置一般有个附加选项：格式化内部存储空间，一般很少用。
3.解决效果不同：
刷机可以解决的问题恢复出厂设置一般都可以解决；所以但是有些问题只有恢复出厂设置才可以解决一些软件问题，刷机不能解决，但是当遇到系统崩溃，无法正常启动的情况下，而是系统本身有问题，那只有刷机才能解决。
参考资料：百度百科-刷机
参考资料：百度百科-出厂设置
本回答被网友采纳备份与重置/恢复出厂设置包含「还原所有设置」和「清除所有数据」两项功能：
一、还原所有设置
即将手机中的各项设置恢复到出厂状态，比如：闹钟、壁纸、网络设置、铃声等，但不会删除手机中的任何数据或媒体。
二、清除所有数据
会清除手机上的所有数据（SD卡数据除外）,包括下载的软件、电话本、登陆的帐号（部分机型会清除vivo帐号）等。
注：此操作前请备份手机中的重要数据
在什么情况下需要恢复出厂设置？
想释放内存 ：手机长期使用后，软件会产生大量的缓存数据，而导致手机运行不流畅，故而可以恢复出厂设置来释放内存。
手机出现异常问题 ：当手机出现异常，但是已经没有其它办法解决时，可以尝试使用恢复出厂设置来恢复正常。
手机升级、刷机后 ：手机升级、刷机后出现了莫名其妙的问题，比如经常无故重启、掉电加快、卡顿等，这些情况都可以试试恢复出厂设置。
温馨提示：操作备份与重置/恢复出厂设置前，备份好手机中的重要数据。
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手机刷机与恢复出厂设置的区别：刷机数据都会被清空掉，功能可以根据刷机包不同任意添加新功能，而恢复出厂设置，存储的数据是不会删除掉了，系统本身也没有增加或减少功能还是原来的系统。
1、刷机：手机方面的专业术语，是指通过一定的方法更改或替换手机中原本存在的一些语言、图片、铃声、软件或者操作系统。刷机就是给手机重装系统，可以是刷入官方的系统，也可以是刷入经过修改过的系统。刷机之前手机的所有数据都会被清空的，而且是必须清空。
2、恢复出厂设置：出厂设置即物品出厂时的默认状态，如开始界面，待机方式，操作快捷键，原先预装的软件，还有设置的参数都会恢复到出厂设置好的样子，系统是没有改变的，定时提醒等功能恢复但不会删除存储的数据。
3、恢复出厂设置是相当于将手机自行安装的软件、联系人及多媒体信息等进行总清除，系统恢复到出厂时的软件环境。在您需要将手机恢复出厂设置时，可以备份重要数据，自行进行恢复出厂设置。但刷机不属于手机的常规操作，为了保证您系统的稳定，不建议自行刷机。
本回答被网友采纳刷机：刷机，手机方面的专业术语，是指通过一定的方法更改或替换手机中原本存在的一些语言、图片、铃声、软件或者操作系统。通俗来讲，刷机就是给手机重装系统，可以是刷入官方的系统，也可以是刷入经过修改过的系统，刷机之前手机的所有数据都会被清空的，而且是必须清空。
恢复出厂设置：出厂设置即物品出厂时的默认状态，如开始界面，待机方式，操作快捷键，原先预装的软件，还有设置的参数都会恢复到出厂设置好的样子，系统是没有改变的，定时提醒等功能恢复但不会删除存储的数据。
两者最主要区别，刷机数据都会被清空掉，功能可以根据刷机包不同任意添加新功能，而恢复出厂设置，存储的数据是不会删除掉了，系统本身也没有增加或减少功能还是原来的系统。