1949年4月24日，太原解放。
1949年5月6日，太原市新置内、外各4个区，共8个区。
1950年2月8日，太原市并8个区为4个区，外一、二区合并为第四区。
1951年4月2日，晋源区从汾阳专署划归太原市。8月撤销晋源县建置，并于汾河东新建太原市第七区，驻北格镇。
1954年1月2日，撤销第四区建置，将第七区改名为第四区，区政府驻地由北格镇移驻小店镇。6月4日，第四区改名为小店区。
1957年3月12日，撤销小店区建置，成立太原市郊区。
1958年9月，郊区所辖乡镇成立人民公社。
1959年3月，撤销郊区建置，今境域属南城区管辖。1960年3月，恢复太原市郊区建置。太原市成立9个城市人民公社，2个农村人民公社（小店、晋祠）。
1961年5月18日，撤销“大公社”建置，恢复南城、晋源等区。
1963年4月1日，撤销晋源区建置，将太原市所辖农村人民公社合并成立太原市郊区。
1970年3月26日，撤销太原市郊区建置，新置南郊区、北郊区。
1980年11月12日，南郊区亲贤公社所属程家村、旱西关、水西关、大南关、老军营、牛站、菜园7个生产大队划入太原市南城区。
1984年，废除人民公社建置、恢复乡镇村建置。
1997年5月8日，设立太原市小店区、迎泽区、杏花岭区、尖草坪区、万柏林区、晋源区。
1997年12月12日，拟成立太原市小店区，由原太原市南城区坞城街道、双塔街道、北营街道和原南郊区亲贤乡、黄陵乡、小店镇、北格镇、刘家堡乡、西温庄乡、郝庄乡、狄村组成。
1998年1月1日小店区挂牌成立。
2000年，小店区对街道、乡镇区划进行调整，双塔街道更名为营盘街道、亲贤乡更名为平阳路街道、黄陵乡更名为黄陵街道。 小店区内有汾河、潇河、五龙沟沙河、黑驼沙河等季节性河流。
偏硅酸复合型矿泉水主要分布在小店区。
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