1、职称等级不同
主任医师是医生职称中的最高级别，属于正高级别职称，相当于医学院校的教授。而主治医师属于中级职称，比主任医师低至少2个级别，相当于医学院校的讲师。
2、对应职称的计算机报考科目不同
高级职称（主任医师）考5个模块，一般推荐WindowsXP ，Word2003 ，Excel2003 ，PowerPoint2003 ，Internet应用。职称（主治医师）考3个模块，一般推荐Word2003 ，PowerPoint2003 ，Internet应用。
3、胜任条件不同
主任医师的晋升条件除相关专业和技术经验外，还需要具备一定的科研能力和水平。
为精通本科理论，掌握国内外本科技术发展情况，并能吸取最新科研成就应用于实际工作(中医药专业须精通中医药理论，对经典医著有所研究)。
有丰富的临床或技术工作经验，能熟练地掌握本科技术操作，解决本科复杂疑难问题。能熟练地掌握一门以上外国语(中医、中药人员暂不作为必备条件)，并有较高水平的科学论文或著作。善于指导本科全面业务，能为医疗、教学和科研培养出高级人才。
主治医师的晋升条件对应不同专业和医师工作经验要求有所不同。医学中专毕业，在县及以下基层医疗机构工作，取得医师资格后从事医师工作不少于七年。医学大学专科毕业，取得医师资格后从事医师工作不少于六年。医学大学本科毕业，取得医师资格后从事医师工作不少于五年。
参考资料来源：百度百科-主治医师
参考资料来源：百度百科-主任医师
主任医师职责
1、在科主任领导下，指导全科医疗、教学、科研、技术培训与理论提高工作。严 格执行各项医 疗制度，认真完成本职要求的病历等各项医疗记录。
2、定期查房并亲自参加指导急、重、疑难病例的抢救处理与特殊疑难和死亡病例的讨论、会诊。
3、指导本科主治医师和住院医师做好各项医疗工作，有计划地开展基本功训练。
4、担任教学和进修、实习人员的培训工作。
5、定期参加门诊工作。
6、运用国内、外先进经验指导临床实践，不断开展新技术，提高医疗质量。
7、督促下级医师认真贯彻执行各项规章制度和医疗操作规程。
8、指导全科结合临床开展科学研究工作。
9、严格执行传染病报告和管理制度。
住院医师一词来自国外，在美国医学院毕业生要到医院做住院医师，顾名思义这个医生24小时吃住在医院里，随时处理病人的病情变化，是培养一个真正能独立看病的医生的必须途径。国内以前也试行过，但最终没有全面开展，部分医院只要求住院医师12小时吃住在医院，可以回家睡觉。
一般来说，只有副主任医师以上职称的才算是专家，但不是所有副主任医师都是专家，一些小地方的副主任医师最多只能算本地的“专家”。
区别：主任医师级别更高
级别不同：主治医生是中级职称，副主任医师和主任医师是高级职称。
2.工作重点不同：住院部的住院医生和主治医生要具体负责病房和患者,主任医师不负责具体病人,定期进行大查房。
3.责任不同：下级医师有疑问,可请示上级医师。重大手术多由职称高的主刀。
4.如果在门诊工作,都同样是看病开方,但一般只有高级职称才能是专家门诊,有技术特长的主治医生可以是专科门诊,初级职称只能出门诊。
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住院医师；
主治医师；
副主任医师；
主任医师；
按照级别在临床医疗活动中，主任医师可以指导副主任医师的医疗工作，副主任医师可以指导主治医师的医疗工作，主治医师可以指导住院医师的医疗工作。当然主任医师也可以直接指导他级别以下的医师的医疗行为。主任医师级别一下的医师，在临床工作中遇到困难，也可以向上级医师直至主任医师反映或请教。