1、车被运管所扣了罚款一万，问题的关键在于你是否是合法营运，如果是非法的：非法营运是指没有依法取得营运权而实施了营运行为。即未按规定领取有关主管部门核发的营运证件和超越核定范围进行经营。
2、《中华人民共和国道路运输条例》第六十四条规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或违法所得不足2万元的，处以3万元以上lO万元以下的罚款。
3、一般来说是不会有负刑事责任，但是申请法院强制执行的话，还是有一定的麻烦，比如查扣正常合法资产，然后低价变卖以缴纳这笔罚款另外，时间越长，滞纳金越高。基本上是财产上的损失。
4、非法营运被扣留，需要缴纳罚款，情节严重的可以执行强制过户拍卖，部分地区，扣留黑车60天以后，无人处理就会执行，具体期限要以当地执法部门来定，没有明确的规定。《关于无证经营查处取缔办法》（以下简称《办法》）完全适用于当前的非法营运无照经营的问题，并具体指出，“未依法取得许可证、批准文件和营业执照擅自从事客运经营活动——私家车营运、套牌车营运、外地车跨地区营运，均属于非法经营行为”。