我认为有以下五种。
第五名：白眼
白眼和写轮眼都是源于大筒木一族的瞳术，在火影忍者的剧情中，白眼的表现虽然不如写轮眼惊艳，但是在设定上白眼的能力确实要胜过写轮眼。白眼的观察能力非常强，拥有接近360度的视野范围，且可以穿透障碍，超远距离的进行观察。在对战过程中，白眼可以看到忍者身上的所有查克拉穴道，利用“封堵穴道”对敌人进行攻击。
第四名：净眼
博人是鸣人和雏田的儿子，由于继承了两种特殊的基因，年纪轻轻的博人就开启了一种特殊的瞳术“净眼”。在目前的剧情中，只有博人拥有这种瞳术，虽然开发程度还比较浅，但是作为主角的独有瞳术，净眼的真正实力必然是非常强大的。我们知道，写轮眼进化到轮回眼，中间会有万花筒写轮眼的过渡，而净眼也许就是白眼进化到转生眼的过渡状态。
第三名：万花筒写轮眼
写轮眼是宇智波家族的基础瞳术，很多人都能够开启，但是能够晋级为万花筒写轮眼的人就非常少了。万花筒写轮眼的开启条件十分苛刻，需要经历极大的痛苦刺激才能够获得。宇智波鼬是因为目睹了挚友的惨死才开启的，带土则是亲眼见到了挚爱琳的惨死，而佐助则是在获悉哥哥宇智波鼬的真相后开启的。每一种万花筒写轮眼都拥有特殊的瞳术，其中宇智波鼬为天照和月读，带土为神威，佐助的万花筒能力则是天照和加具土命。
第二名：轮回眼
写轮眼的终极进化形态，在火影忍者的正篇剧情中，轮回眼的能力非常闪耀，被封为最强大的瞳术。曾经拥有过轮回眼的人包括宇智波斑，宇智波带土，长门，佐助以及大筒木家族的若干成员，其中长门和带土的轮回眼全都是宇智波斑斑的。获得轮回眼后，能够使用地爆天星，神罗天征等强大技能。其中宇智波斑还能够使用轮墓·边狱，佐助掌握了天手力这种空间技能。
第一名：转生眼
在火影忍者剧场版《the last》中，大筒木舍人作为boss登场，而他拥有瞳术就是净眼！在岸本的设定中，净眼的能力甚至超越了轮回眼，能够控制月球的轨迹，具备毁灭世界的力量。除此之外，转生眼还能够直接控制对方的意识，吸收别人的查克拉。在博人传未来的剧情中，小葵和博人都是有希望掌握这种瞳术的。
以上均为个人观点，不喜勿喷。