存在的位置不一样：
1.亚麻酸只存在于深绿色植物中，是构成人体组织细胞膜和生物酶的基础物质，紫苏籽油是目前所发现的所有天然植物油中α-亚麻酸含量最高的，高达50%-70%。
2.亚油酸在动物脂肪中的含量一般较低，如牛油为 1.8%，猪油为6%；在植物油中含量较高，如花生油为26%，豆油为57.5%，菜油为15.8%。
功能不一样：
亚麻酸进入人体后，在酶的催化下，转化成 EPA、DHA、DPA和PG前列腺素等被人体吸收。亚麻酸具有很强的抗血栓、降血压、降低血脂、降低胆固醇、增强智力、保护视力、延缓衰老、抗过敏、抑制癌症的发生和转移等广泛的生理、药理作用。
胆固醇必须与亚油酸结合后，才能在体内进行正常的运转和代谢。如果缺乏亚油酸，胆固醇就会与一些饱和脂肪酸结合，发生代谢障碍，在血管壁上沉积下来，引发心脑血管疾病。所以亚油酸能降低血液胆固醇，具有预防动脉粥样硬化的作用。
拓展资料
亚油酸的简介
亚油酸CH3（CH2）4CH=CHCH2CH=CH（CH2）7COOH，不饱和脂肪酸的一种。为以甘油酯形态构成的亚麻仁油、棉籽油之类的干性油、半干性油的主要成分。
若干种植物油中含量较高，占红花籽油的总脂肪酸的76%-83%，占核桃油，棉籽油、向日葵种子油、芝麻油的总脂肪酸的40—60%，占核桃油、花生油、橄榄油的总脂肪酸的25%左右，动物脂肪中亚油酸的含量一般较低，如牛油为1.8%，猪油为6%。
因为在空气中易氧化变硬，所以也称为干性酸，含干性酸多的油亦称为干性油。用硒在200℃或以氮的氧化物处理时，转变为反式亚油酸。氢化时先变成12-十八（碳）烯酸和油酸，进一步氢化变成硬脂酸。
亚油酸是人和动物营养中必需的脂肪酸。亚油酸的钠盐或钾盐是肥皂的成分之一，并可用作乳化剂等表面活性剂。在医药上可用于治疗血脂过高和动脉硬化等症。其铝盐可用于制造油漆、涂料等。
亚麻酸的简介
亚麻酸简称LNA，属ω-3系列多烯脂肪酸（简写PUFA），为全顺式9、12、15十八碳三烯酸，它以甘油酯的形式存在于深绿色植物中，是构成人体组织细胞的主要成分，在体内能合成、代谢，转化为机体必需的生命活性因子DHA和EPA。
然而，它在人体内不能合成，必须从体外摄取。人体一旦缺乏，即会引导起机体脂质代谢紊乱，导致免疫力降低、健忘、疲劳、视力减退、动脉粥样硬化等症状的发生。
尤其是婴幼儿、青少年如果缺乏亚麻酸，就会严重影响其智力正常发育，这一点已经被国内外科学家所证实，并被世界营养学界所公认。另外，缺乏α-亚麻酸，维生素、矿物质、蛋白质等营养素不能被有效吸收和利用，造成营养流失。
参考资料：