重庆盐业的历史可以追溯到1965年8月，当时重庆市糖业烟酒公司的一个部门——重庆盐业运销站独立成立。随后，在1983年10月，这个机构更名为四川省盐业公司重庆分公司，开始了其新的发展阶段。
1997年6月，随着重庆的直辖，市政府决定对盐业进行重大调整。重庆市盐业总公司在这一背景下设立，直属重庆市国有资产监督管理委员会，级别为正局级，标志着重庆盐业进入了新的管理体系。
2006年6月，重庆市委和市政府的会议决定，重庆市国资委将重庆市盐业总公司与重庆化医控股（集团）公司进行整合。从2006年1月1日起，重庆市盐业总公司被无偿划归给重庆化医控股（集团）公司，成为其全资子公司，尽管如此，重庆市盐业(集团)有限公司仍然保持了独立的法人资格。重庆化医控股（集团）公司自此开始履行对重庆市盐业(集团)有限公司的出资人职责。
2008年12月，重庆市盐业(集团)有限公司完成了名称的最后一次变更，正式定名为至今的名称，标志着其在整合后的新时期里继续稳健发展。
重庆市盐业（集团）有限公司是重庆市加碘食盐专营经济实体，承担着全市盐的生产经营和供应工作，为重庆化医控股（集团）公司的全资子企业，具有独立法人资格。重庆市盐务管理局是市人民政府盐业行政主管部门，正局级建制，主管全市盐业工作，负责全市盐业行业管理、盐政执法和食盐专营工作。局司一套班子、两块牌子、职能分设、合署办公。