南通教育全国最好，主要是因为南通有着深厚的人文积淀和教育传统、坚持优质均衡发展的理念、创新整合全市最优质教学资源、积极开展教育改革试点。
1、有着深厚的人文积淀和教育传统
南通历史悠久，文化底蕴深厚，崇学重教，人才辈出。南通是中国近代文化科教史上创办了第一所师范学校、第一座民间博物苑、第一所纺织学校、第一所刺绣学校、第一所戏剧学校、第一所中国人办的盲哑学校和第一所气象站等“七个第一”的地方，被称为“中国近代第一城”。
2、坚持优质均衡发展的理念
南通是全国首批所辖县（市、区）全部通过国家义务教育发展基本均衡县（市、区）评估认定的地级市。为了进一步提高义务教育质量和公平水平，南通在全省率先地方立法，出台了《南通市义务教育优质均衡发展条例》。
《条例》坚持五育并举，因材施教，为每一名学生提供适合的教育；解决大校额、大班额问题，加快提档升级，做到“校校达标”“项项达标”；实现教师队伍素质更强、待遇保障更强、管理制度更强；确保学校各项指标和人民群众满意度双合格，让老百姓在家门口就能上到优质的学校。
3、创新整合全市最优质教学资源
南通充分发挥传统名校示范引领作用，推动与普通学校、农村学校和新建学校结对，推进校长教师流动。南通组建起20多个以特级教师为核心的科研集团军，以专项课题为纽带带动教学骨干和教科研能手共同成长。
南通还创新整合全市最优质教学资源，在全市最强的9所四星级中学分别建立语、数、外等9个名学科基地，每所学校分别领衔攻关，成果出炉后，立马与全市所有学校共享，即使最偏远的学校也能在高平台上均衡发展。
4、积极开展教育改革试点
南通围绕提升教育水平，自觉变革教育思想，改革人才培养模式、办学体制、管理体制和保障机制，为全省全国教育改革贡献了“南通智慧”。南通市承担了多项国家级、省级教育改革试点。
2019年，南通“全国青少年校园足球改革试验区”建设经验被中央教育工作领导小组推介；2020年，获评“全国优秀校园足球改革试验区”，全国青少年校园足球夏令营选拔赛南通市11人入选最佳阵容，入选人数列全省地级市首位；2020年，南通入选基础教育国家级优秀教学成果推广示范区。