大气物理专业大学排名的前三名是南京大学、南京信息工程大学和大气物理所。
1、南京大学
是一所综合性的国家重点大学，也是“985工程”和“211工程”重点建设的高校之一。南京大学的大气科学专业在2023年全国排名第3位，在QS世界大学环境科学排名中位列第51-100位。南京大学的大气科学专业有着悠久的历史和雄厚的师资力量，拥有国家重点实验室。
南京大学拥有多个校区，其主要校区位于南京市鼓楼区，校园内绿树环绕、历史建筑与现代设施相结合，为学生和教职工提供了优美的学习和工作环境。南京大学拥有多个学院，涵盖了基础学科、工程技术、人文社会科学等各个领域。
2、南京信息工程大学
是一所以气象、海洋、环境为特色，以信息科技为支撑，多学科协调发展的高水平教育部直属高校。南京信息工程大学的大气科学专业在2023年全国排名第2位，在QS世界大学环境科学排名中位列第101-150位。南京信息工程大学的大气科学专业有着鲜明的特色和优势。
南京信息工程大学拥有一支高素质的师资队伍，以及先进的实验教学设施。学校注重培养学生的实践能力和创新精神，积极开展产学研合作，形成了丰富的科研成果。同时，学校还积极参与国际交流与合作，与多所国外知名大学建立了紧密的合作关系。
3、大气物理所
是中国科学院下属的一个研究机构，是中国最早从事大气物理研究的单位之一。大气物理所与北京师范大学联合培养博士生和硕士生，其专业实力在全国排名第1位。大气物理所拥有一支高水平的科研队伍，承担了多项国家重点基础研究计划和国际合作项目取得了重要的科研成果。
大气物理所的研究内容包括大气动力学、边界层气象学、大气化学、云-降水物理、气候系统与气候变化等诸多领域。通过观测、实验和数值模拟等手段，大气物理所旨在深入挖掘大气过程的物理本质，从而为天气预报、气候预测和环境保护等工作提供科学依据。
以上数据来源于是南京大学、南京信息工程大学和大气物理所的学校官网。