公司被别人登记软件著作权只要有合法的证据就可以起诉解决。起诉的具体流程是：
1.起诉：向有
管辖权的法院立案庭递交诉状。
2.立案审查：符合立案条件，通知当事人7日内交
诉讼费，交费后予以立案;不符合立案条件，裁定不予受理，裁定驳回起诉。不服驳回起诉裁定，10日内向上级人民法院提出上诉。
3.起诉受理后。
法院5日内将
起诉状副本送达对方当事人，对方当事人15日内进行答辩。
4.排期开庭。
提前3日通知当事人开庭时间、地点、承办人，公开审理的案件提前3日进行公告。
5.开庭审理。
宣布开庭，核对当事人身份，宣布
合议庭成员，告知当事人权利义务，询问是否申请回避。
6.达成调解协议。
制作
调解书，双方当事人签收后生效。当事人履行调解书内容或申请执行，向法院告诉庭提出再审申请。
未达成调解协议，合议庭合议作出裁决(宣判)：同意判决的，当事人自动履行裁判文书确定的义务或向我院告诉庭提出执行申请。不同意裁判的，裁定送达之日起10日内向上级人民法院提出上诉，判决送达之日起15日内向上级人民法院提出上诉。
拓展资料：侵犯软件著作权的行为有哪些有下列情形之一的，除另有规定外，属于侵犯
计算机软件著作权的行为：
1.未经软件著作权人许可，发表或者登记其软件的。
2.将他人软件作为自己的软件发表或者登记的。
3.未经合作者许可，将与他人合作开发的软件作为自己单独完成的软件发表或者登记的。
4.在他人软件上署名或者更改他人软件上的署名的。
5.未经软件著作权人许可，修改、翻译其软件的。
6.其他侵犯软件著作权的行为。
7.复制或者部分复制著作权人的软件的。
8.向公众发行、出租、通过信息网络传播著作权人的软件的。
9.故意避开或者破坏著作权人为保护其软件著作权而采取的技术措施的。
10.故意删除或者改变软件权利管理电子信息的。
11.转让或者许可他人行使著作权人的软件著作权的。