办公室是校研团委的综合办事机构，它综合协调上级各指导机关、研团委各职能部门之间的工作关系，在研团委内部起着承上启下、综合协调的中枢和纽带的作用。办公室的工作要点可以简要地概括为“三个中心”和“两个保障”，即“信息中心、管理中心、交流中心”、“办公保障、财务保障”。办公室的主要部门和职能如下：
综合组：负责办公室内部各部门的服务与管理工作，负责部门例会的策划和组织，以及部门的感情建设，起着办公室内部交流的纽带作用；同时兼顾部门内部的培训工作和突发工作的协调安排等。
创新服务组：负责校研团委各部门之间的感情建设，组织部门沙龙、男女生节活动、生日会及羽毛球赛篮球赛等集体活动，营造校研团委内部的友好互动氛围；通过“清研团办”微信公众号，挖掘研团同学工作背后的故事，展示研团同学的风采；探索、优化和创新校研团委的办公模式，提高工作效率。
会务组：负责校研团委书记会、大小部长联席会、总支书记例会的组织协调，及会议的相关服务工作；负责各类通讯录的及时更新，编制研究生工作系统通讯手册和校研团委干部简历手册等；
外事协调组：负责协助承办与研究生相关的大型外事活动，如国内外政要人士、著名高校学者来访交流等，主要涉及活动的前期通知报名工作，以及活动现场的会务组织等工作。负责协调校研团委与外单位、外校学生组织的工作交流。协助统筹全校研究生大型活动（开学典礼、毕业典礼等）的组织工作。
信息组：负责校研团委工作周报、工作上报、研团研会工作周报、研工部简讯、校团委月度工作总结及工作计划的搜集整理，协助做好校研团委内部信息报送的培训及服务工作。
文档组：负责收集整理校研团委各部门的学期初工作计划和学期末工作总结，研究生团委各类文件的管理及FTP的维护；负责校研团委大型活动的申报、文档管理和保存，编写大型活动开展流程以指导各部门规范开展各项活动，编撰研究生团委年鉴。
公共管理组：负责校研团委仓库的布置和管理，公共物品的记档、会议室预定、会议室维护等；负责制作研团主要骨干及总支书记风采照片墙；负责制作校研团委主要干部名片等。
财务管理组：负责校研团委的财务管理，推行各部门的预决算制度，定期组织各部门财务报销，安排财务培训，科学化管理执行财务审计工作。 组织部是校研团委在组织工作方面的执行机构，主要从组织建设和人才培养的角度促进研究生团委工作的顺利开展。组织部工作本着“抓落实、促提高、见实效、重服务”的方针，主要围绕以下几个方面开展工作：
骨干服务组：负责研究生团系统的骨干队伍建设。主要工作包括骨干选拔推荐、骨干培养、骨干考核、骨干交流等工作。骨干服务组在“扩大比例、提高水平、构建体系、重点引导”的指导思想下进行骨干队伍建设，扩大骨干来源，加强骨干队伍管理，推动骨干梯队建设，此外还负责研团委的常委会和全委会的会务工作。
骨干培训组：负责各级研究生团组织和团干部的培训工作。主要包括暑期团校（研究生班）暨新生骨干训练营工作，研究生社工骨干领导力培训课程等工作，以加强骨干队伍思想建设、提高研究生社工骨干的工作能力，强化研究生社工系统网络，打造一支高素质的骨干队伍。
骨干研修组：负责研究生社工骨干研修班的开展与组织。研修班服务于学校高素质、高层次、多样化、创新性的人才培养目标，主要工作包括学员招募和选拔、学员培训、红色团队建设和暑期短期挂职、政务体验等工作。研修班通过全面系统的学习和实践活动，促进学员对国情党情的认知，坚定学员的共产主义信念，帮助学员树立服务国家和社会的理想和目标，提高学员的责任意识和综合能力，以期成长为“跨学科、复合型、应用性”的高素质人才。
基层联络组：负责院系研团总支的联络与建设工作。主要包括基础团务工作，院系联络工作等，以促进院系研团组织建设，使得团工作继续从校级拉动型向校、系、支部（班级）三级互动型转变。
基层专项组：负责院系研团总支评优工作，全面衡量和展示院系研究生团总支的建设成果，促进工作交流，推进工作创新，完善工作体系，激发工作的积极性、主动性和创造性，实现“以评促建、评优学优”的效果，推动我校研究生共青团工作水平稳步提高，更好地服务于广大研究生的成长成才。
基层团务组：组织开展研究生集体建设的理论研究、案例分析、情况调研工作，承担学校研究生集体建设的相关研究任务；负责实施研究生先进集体的评选工作，并对优秀集体进行宣传、提炼经验、总结推广；制定研究生集体建设方法的案例集及相关指导性手册，为研究生集体建设提供指导与支持；负责研究生共青团相关组织制度的建设和落实和校研团委自身的组织建设，筹备和组织团员代表大会、团员代表会议、全委会；开展基础团务工作，包括团员信息统计，团证注册，团证补办，团费收缴等；完善，修订，推行《清华大学研究生基层集体工作手册》；加强对团工作的理论学习，收集，研讨和宣讲共青团相关的重要讲话、文件、书籍等材料，面向组织部开展内部培训。
主题教育组：结合学校“行健新百年，共筑中国梦”主题教育的整体安排，紧密围绕“社会主义核心价值观”学习实践活动的中心要求，充分依托院系研团总支，充分吸收和整合资源，做好顶层设计，点面结合地推动思想引领与主题教育工作。
综合组：组织召开组织部部务会、全体会以及部内各项培训会；负责部内工作制度建设、财务工作，协调组织部各组常务工作的开展。牵头负责部门项目性工作（非计划型）的开展，负责研团研会各类大型项目的人员协调与组织（新）；组织部相关文件、文号的管理与存档；促进部内工作交流和情感建设。负责与上级组织的沟通。 宣传部的工作职责是配合学校及研究生院中心工作，根据我校研究生团员的思想状况，策划、组织我校研究生方面的重点宣传报道任务，建设校级研究生媒体等宣传阵地，推动院系研团总支宣传工作开展。宣传部设有如下媒体平台：
研通社：拥有覆盖各院系研究生的记者团和通讯员队伍，以及全校唯一一支面向校级高端采访的外事记者队伍；与“新华网”、《中国教育报》、《中国青年报》等外部媒体广泛联络，与“清华新闻网”、《新清华》等校级媒体深入合作，全面展示清华研究生风采。
《清华研究生》报：全国首家研究生报纸，是宣传战线的一面旗帜，每期发行10000份，覆盖面广、影响力大；作为《中国研究生》北京通联站，是在京高校研究生相关的信息枢纽和资源中心。
博学网：面向清华研究生的综合信息网站，以打造研究生学术资源平台和工作信息平台为核心竞争力，集合了资源共享、新闻发布、视频点播等诸多功能，引领研究生网络生活新方式。 实践部是学校研究生工作系统开展“启航计划”就业引导工作的主要协调部门，其中心工作是配合学校在全校研究生范围内开展以提高研究生社会适应力和就业竞争力的社会实践活动，负责全校研究生社会实践活动的宣传、申报、培训及指导等工作；建立研究生就业实践基地，开展以就业引导为核心的“启航计划”系列活动与就业实践活动等，并进行职业培训、生涯规划等就业引导工作。实践部下设综合组、基层组、项目组、宣传组、调研组、调度中心和启航中心。
自2003年在全校研究生中开展“启航计划”以来，已累计有5000余名研究生参加就业实践活动，有力地促进了学校的研究生就业引导工作。从2009年以来，校党委研究生工作部、校研究生团委在充分总结经验的基础上，提出“建设基地，组织实践，加深了解，坚定选择”的新思路，进一步加强研究生就业实践的系统化、规范化，吸引了更多的研究生同学参加就业实践活动并引导其就业择业。 清华大学紫荆志愿者研究生服务团是一支以清华大学在校研究生为主体的年轻而富有朝气的志愿者队伍。服务团积极倡导“奉献、友爱、互助、进步”的志愿者精神，旨在组织、协调清华大学研究生志愿者活动，为校园和社会提供志愿服务，培养清华研究生的主人翁意识和奉献精神，倡导良好的校园风气。紫荆志愿者研究生服务团目前采取理事会形式管理日常事务，设团长一名，副团长六名（分管内务、宣传、项目、院系和两支专项队伍工作），理事六十余名。
