医学哲学是哲学在医学领域的分支，是对医学中一般规律和范畴进行哲学研究的一门边缘性学科。
医学哲学的研究领域是医学，但研究对象不是医学及其分支学科所关注的具体现象和具体规律，而是普遍现象的一般本质和一般规律。因此，医学哲学是医学最高层次的理论学科，又是介于医学与哲学之间的交叉学科，也是一个充满活力、争议不断、与时俱进的学科。
医学哲学既古老又年轻，因为医学哲学思想早在中国西周、西方的古希腊时期就已经萌芽了，而医学哲学作为一种学科，不过有几十年的历史。
医学哲学的历史就是医学与哲学相互联系、相互结合的历史，从最初的医学辩证法发展到日益膨胀的医学人文社会学科群（如医学社会学、医学伦理学、医学人类学、医学美学）。
在医学没有理性化之前，医学家总是自觉或不自觉地用某种哲学观点来指导自己的医疗实践，总结自己的医疗经验和成果。因此，医学发展的历史进程，总是受当时哲学思想的影响，与当时哲学思想的发展状况相适应。
医学哲学思想渊源悠久。我国传统医学所运用的语言材料、表述形态，都与古代哲学思想密不可分。《周易》之卦爻理论、中庸辩证法；《黄帝内经》中的天人相应思想及形神理论；宋明理学援引的太极本体论，都勾勒出了传统医学的理论特色和方法论特点；中国传统医学以古代的阴阳五行说构建理论框架，认为“阴阳者，天之道也”，而“生之本，本于阴阳”。
人体健康是机体内部之间、机体与环境之间的对立统一，即“阴平阳秘”，人体疾病是阴阳失衡的结果。中国古代的阴阳五行说本是一种朴素的唯物主义和自发的辩证法，传统医学的阴阳五行说就是中国古代自然哲学思想与医学相结合的结果，其蕴含的合理性对传统医学的疾病诊治及西方医学哲学影响深刻。
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