1、定义不同
SPA：SPA一词源于拉丁文“SolusParAgula”（Healthbywater）的字首，Solus（健康），Par（在），Agula（水中），意指用水来达到健康，健康之水。
水疗：水疗(hydrotherapy)是利用不同温度、压力和溶质含量的水，以不同方式作用于人体以防病治病的方法。
2、起源不同
SPA：关于SPA一词起源的探讨中有一个词始终贯穿其中，那就是“水疗”，它反映了水在古时的治疗领域和早期欧洲SPA文化中的重要作用。多数人认为SPA一词是一些拉丁短语的首字母组合，如“sanitasperaquam”，“solusperaquam”，“sanusperaquam”。
这些短语都有“用水治疗”的意思。另一种说法是SPA源于在罗马浴室中发现的涂鸦“salutperaquam”。SPA也可能源于瓦龙语的“espa”，意思是喷泉，或源于拉丁语“spagere”，意思是泼水。
有些专家认为该词源于比利时一个以温泉著称的叫spa的小镇。后来，spa一词就被用于温泉和提供水疗的疗养胜地。在19、20世纪，饮用矿泉水或在矿泉中洗浴成为时尚的休闲方式。
水疗：早在古希腊时代，西方医学之父希波克拉提斯(Hippocrates)就使用温泉做治疗，此外古代中国、日本亦有温泉疗法的记载。
直到18世纪-19世纪，德国水疗之父SebastianKneipp等人发表，将水疗做为正式医疗用途。水疗常用来治疗肌肉、骨骼等方面的疾病，而坊间流行的“SPA”亦为水疗的一种。
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3、种类不同
SPA：依照SPA的不同用途来区分可分为：都会型SPA（DaySpa）、美容SPA（BeautySpa）俱乐部SPA（ClubSpa）、饭店/度假村SPA（Hotel/RestortSpa）、温泉型SPA（MineralSpringSpaHairSPA。
水疗：可分浸浴、淋浴、喷射浴、漩水浴、气泡浴等；按其温度可分热水浴（39℃以上）、温水浴（37-38℃）、不感温水浴（34-36℃）、低温水浴（26-33℃）和冷水浴（<26摄氏度）；按其所含药物可分碳酸浴、松脂浴、盐水浴和淀粉浴等。
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