医院信息系统是对医院的各科室的各项业务及各种医疗活动进行数字化及网络管理和数据处理，它涉及全部信息管理，主要包括以下四类子系统。
1.行政管理系统
在医院信息系统中，医院行政管理子系统涉及医院的各科室的行政管理，主要包括人事管理系统、财务管理系统、后勤管理系统、药库管理系统、医疗设备管理系统、门诊和手术及住院预约系统、病人住院管理系统等。
2.医疗管理系统
HIS
医疗管理系统主要是医院涉及的医疗业务方面的信息处理，主要包括门诊、急诊管理系统，病案管理系统，医疗统计查询系统，血库管理系统等。
3.决策支持系统
决策支持系统主要是有关医疗业务质量等方面的处理，包括医疗质量评价系统、医疗质量控制系统等。
4.其他各种辅助系统
除了以上的行政管理系统、医疗相关业务处理系统，还有其他的辅助系统，如医疗情报检索系统、医疗数据库系统等
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