《仙剑奇侠传三》故事发生在《仙剑》第一代的五十年前，那时候，李三思刚刚发出赤子的第一声啼哭；巫后还是襁褓中的婴儿，而剑圣，则还没有拜入蜀山修仙……
事情的起因是从锁妖塔顶端突然坍塌，封印被解除开始的，但是，更深层的因果却要追溯到千年前的神界。
神将军飞蓬与魔将军重楼因两界的冲突而屡屡交手，一直难分胜负，两人逐渐有惺惺相惜之意。
重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗，一较高下，飞蓬碍于神界天规而犹豫再三，最终经不起重楼诱惑而答允。
两人势均力敌，比试旷日持久，最终惊动了天庭，天帝派兵捉拿飞蓬问罪，飞蓬因感知到追兵将至而分心，佩剑被重楼打落人间而落败……
光阴荏苒，飞蓬被神界问罪贬为人，经过多次转世成为渝州唐门新安当铺伙计景天。
同时，重楼自魔界窥探人间，偶然发现飞蓬的转世如此卑微平凡，心中动念想要帮助景天，于是来到人间，滋扰蜀山，想要帮飞蓬找回佩剑，无意中毁坏了锁妖塔，偶然得到了飞蓬在人间第一世——姜国太子龙阳铸炼的魔剑。
景天得到魔剑的同时，结识了唐门小姐雪见，从此改变了自己的生活。
一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中，而后遇到蜀山弃徒长卿及其未婚妻紫萱，走上了协助蜀山寻找五灵珠，封印锁妖塔的漫漫征途。
一直隐藏在魔剑中的鬼魂化身而出，竟然是景天前世龙阳的妹妹龙葵。
几个人的情爱纠葛，生离死别反复交织纠缠，雪见的离奇身世，紫萱不为人知的秘密，龙葵长久以来的心中愿望……伴随着人类与妖界死生存亡的争斗，而其实人的欲望，才是所有纷争的本源。
景天
性别：男
年龄：19
种族：人
身高：1.73米
身份：当铺伙计
特长：古董鉴定
最爱：钱，古董
愿望：富有，成为剑仙
性格：随和开朗
贴吧：
http://post.baidu.com/f?kw=%BE%B0%CC%EC 唐门在渝州开设的最大当铺——永安当的伙计，司“管饰”一职，专门保管当铺收押的首饰珠宝类贵重物品。景天不但有鉴别古董珠宝的天赋，而且对买卖、账目能很精通，对保管的当品更有过目不忘的本事。每日幻想有朝一日能富甲天下或成为人人景仰的蜀山剑仙。
雪见
性别：女
年龄：18
种族：无
身高：1.62米
身份：唐门弟子
特长：文学武功医术样样精通（稀松？）
最爱：被人宠
愿望：和祖父健康的生活在一起
性格：活泼刁蛮
贴吧：
http://post.baidu.com/f?kw=%D1%A9%BC%FB 唐门掌门唐坤之最宠爱的孙女，除了限于唐门毒术不能传女的门规之外，其他文学武功医术全部倾囊传授。个性娇纵任性，借着唐家的名头，在江湖上也小有名气。一年前，唐坤年老病重，家族内部权利斗争加剧，雪见失去靠山，倍受排挤欺凌。
龙葵
性别：女
年龄：1000，外观17
种族：鬼
身高：1.58米
身份：生前为姜国公主，现为鬼
特长：双重性格，有强大鬼力
最爱：哥哥
愿望：能拥有身体，成为人
性格：羞怯文静/泼辣张扬
贴吧：
http://post.baidu.com/f?kw=%C1%FA%BF%FB 古国姜国公主，因国都被敌国围困，太子欲铸魔剑而解兵危，剑未铸成而城破。龙葵跃入铸剑炉自尽，魔剑因处女之血而天成……从此龙葵的魂魄和魔剑结为一体，成为流落人间的野鬼，并在千年的修炼过程中，性格分裂为两个。
紫萱
性别：女
年龄：200，外观25
种族：女娲族
身高：1.65米
身份：女娲族后裔
特长：拥有人间至高灵力
最爱：长卿的生生世世
愿望：摆脱宿命，和爱人长相厮守
性格：温柔聪慧，善解人意，外和内刚
贴吧：
http://post.baidu.com/f?kw=%D7%CF%DD%E6 女娲族后裔，饱受情爱煎熬之苦。与第一世恋人相遇时对方已经婚配，两人相爱而不能相守，郁郁而终；第二世虽结为连理，但紫萱不老不死，对方人生几十年匆匆而逝，也留下了遗憾。这一世紫萱暗暗布局，不仅要让恋人长生不老，还要令自己摆脱女娲族宿命……
徐长卿
徐长卿（长卿）
性别：男
年龄：27
种族：人
身高：1.80米
身份：蜀山派弃徒
特长：精通蜀山仙术、剑术
最爱：师门与道义
愿望：能重归蜀山门下
性格：稳重、坚毅，不擅言辞
紫萱相恋三世的恋人。自幼被蜀山掌门收为弟子，武学天赋极高，一度被誉为蜀山一派的接班人，结识紫萱后因违抗师命执意和紫萱结婚而被逐出师门。做出这个决定后内心深自无奈，常常关注师门的消息，并且希望有机缘为师门立功后可以重回师门。
角色特殊能力说明
蜀山仙术 自幼便拜入蜀山的长卿，最擅长的便是蜀山仙术。
操船 蜀山特有的航船，利用灵力驱动，只有蜀山弟子才能用法力使其航行。
战斗特征：力量型角色，攻击力和生命力都非常高。因为出身蜀山，擅长使用单手剑，攻击对象为单体。同时他还能使用具有列攻击范围的长枪。特技偏重于蜀山的符法类，具有极强破坏力。
名字由来：
第二男主角是蜀山弟子徐长卿，这个名字最有意思了，不要怀疑，“徐长卿”这三个字就是一个植物的名字，有趣吧？看这三个字，脑海中就会跳出一个英姿飒爽的剑侠，满面风尘地从故事中走来的样子。入药的话，“徐长卿”有镇静止痛，祛湿解毒的作用（又是解毒，看来仙三已经百毒不侵了！）。另外，这种植物外表虽然是很纤细柔美的，表面上看来缺乏大侠的感觉，但从其药效上看来，内在的刚强也不容忽视，这种“刚柔并济”才是真正的侠者风范！
花楹
性别：女
年龄：100，外观15
种族：妖
身高：1.54米
身份：界于仙、妖之间的妖兽
特长：孕育五毒珠，观心术
最爱：雪见
愿望：和人平等交往
性格：天真纯洁
贴吧：
http://post.baidu.com/f?kw=%BB%A8%E9%BA 天地间唯一能孕育五毒珠的妖兽，具有强大的化解之力，因其力量近于仙而不容于妖类。八十岁修炼成人形后想进入人间，因为毫无心机和不通世事让别人知道了自己有读心的能力，被人类驱逐。后被唐门囚禁豢养用来炼制五毒珠。
重楼
性别：男
年龄：不明，外观30
种族：魔
身高：1.85米
身份：魔尊
特长：精通时空仙术
最爱：紫萱
愿望：追求更强大的力量
性格：任性，执着，好胜
贴吧：
http://post.baidu.com/f?kw=%D6%D8%C2%A5 不老不死的魔神，魔界的魔尊，负责镇守魔界与神界的要冲。因景天的缘故而来到人间，做事一意孤行，不计后果，令人间产生巨变，自身也因此而了解到人间情爱之事……
邪剑仙
性别：男
年龄：不明，外观50
种族：仙
身高：不明
身份：蜀山五长老的邪气所化
特长：可变化成五长老任一位的样子
最爱：杀戮、贪欲、权力、色欲、欺骗
愿望：成为人间统治者
性格：不明
贴吧：
http://post.baidu.com/f?kw=%D0%B0%BD%A3%CF%C9 当年蜀山五长老运用了被祖师禁用的蜀山密术，将自身邪念从身体中排除，封印入锁妖塔，令自身修为大进。哪知邪念竟然修成一体，趁蜀山派混乱之际破坏封印逃出。
买卖还价
主角景天是个商人，自然精通买卖的诀窍，所以买东西的时候喜欢还价。便宜的东西也罢了，像武器装备这样的大宗物资，自然要还还价。
还价系统没有什么限制，自然是漫天要价，就地还钱。最低可以打五折。但是老板的脾气各不相同，要是让他动了怒，小心他永远不卖你东西！
买装备的时候商人会询问是否要预装备，你可以买一件后装备一件试试，也可以一下子买好多件，在出店铺后慢慢装备。
当铺经营
触发特定剧情后，玩家可以投资一个当铺。
根据投资额的多少，玩家会有不同的权利，获得红利是最基本的，还可以调整经营方针，实现资本运作，更可以用低廉的价格收购典当物品，会有意想不到的收获，成为大股东后还可以拥有自己的房间和仓库，就不需要花钱住宿了！
大宝箱
迷宫中有一种特殊的大宝箱，里面通常装了不少好东西，但是很难打开。
每个人有不同的开箱子方法，可都不一定能成功，如果开三次还是没有打开，宝箱就坏了，里面的东西当然就拿不出来了。
尸块冶炼
当战斗阵型五灵法阵中央位置没有人的时候，我方用特定招数打死怪物后，会在中央位置出现怪物的遗留物“尸块”，这些都是冶炼装备的好原料。
在游戏中这个特定的冶炼室，玩家将尸块和宝箱中得到的矿石配合，可以打造究极的装备。
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游戏详细攻略
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