学者们认为十字花科和山柑科在亲缘关系上相近,主要依据两者花的构造非常近似,但山柑科植物花的子房几乎全有子房柄或有1个雌雄蕊柄;而十字花科植物的花,一般无子房柄或雌雄蕊柄。山柑科有草本和木本,而十字花科多数为草本。此外,山柑科植物花的各部分的数目和雄蕊的排列变化较大,雄蕊6至多数(不为四强雄蕊)等,而十字花科花的各部分数目和雄蕊的排列是比较稳定的,可以认为十字花科是从山柑科演化而来的。
不少植物学家根据各自的观点,提出了不同的系统,其中最有代表性和被多数学者所采用的,是O.E.舒尔茨的系统,他于1936年记载本科有350属,共分成19族,其中中国有10族。E.扬兴于1942年对舒尔茨的分类系统进行了修订,他把19族减少为15族。 1. 长柄芥族 Stanleycae O. E. Schulz
植株无毛或有单毛、分叉毛。侧蜜腺稍成环状,和中蜜腺连合。雄蕊超出萼片及花瓣;花丝叉开,细,下部稍加宽;花药线形或长圆形,钝或尖。雌蕊有长柄;柱头几无柄,小,凹陷,略微缺,无显著乳突。长角果圆形或扁平,子叶背倚或缘倚胚根(属1) 。
2. 芸苔族 Brassiceae Hayek
植株有单毛或无毛。侧蜜腺立方形或棱形,顶端平截,有时稍2裂或圆形;中蜜腺近球形或柱状,少数退化。雄蕊花丝少有具齿的(两节荠属 Cvambe L.)。柱头头状或2裂,少数有长而下延的裂片。长角果(两节荠为短角果)有喙 ,通常具上、下不同的2节,不裂或开裂;子叶常为对折(属2-9)。
3. 独行菜族 Lepiditae DC.
植株有单毛、叉状毛或腺毛,或无毛。侧蜜腺成对,离生或连合,有时有突出物,通常无中蜜腺。雄蕊花丝有齿或无,花药短、钝;柱头头状,浅2裂。短角果(弯梗芥属为长角果)开裂,少数不裂(属10-29)。
4. 乌头荠族Euclidicac DC.
植株无毛,或有单毛、分枝毛,有的有腺毛。侧蜜腺汇合或不汇合,中蜜腺有或无,花丝条形,花药钝;子房无柄,少数有极短的子房柄;柱头头状或浅2裂,很少深2裂。短角果不裂或稍裂,坚果状,隔膜多数坚硬。种子子叶直,少数螺旋状内卷,缘倚或背倚胚根(属30-36) 。
5. 庭荠族 Alysseae Gren. et Godr.
植株密被星状毛或“丁”字毛,偶尔杂有单毛或叉状毛。雄蕊花丝具齿、翅或附片,或全无,无齿时常于下部变宽;子房无柄。短角果果瓣与隔膜呈平行扁压。子叶扁平,缘倚胚根,偶为背倚(属37-40)。
6. 葶苈族Drabeae O. E. Schulz
植株被毛或无毛,毛为单毛、叉状毛、星状毛和分枝毛。侧蜜腺通常成对,呈环状或半环状;中蜜腺有或无;雄蕊花丝一般无附属物;子房无柄,少有短柄;花柱短,柱头2裂或头状。短角果,少呈长角果状。种子2行,无翅,少有微翅;子叶缘倚胚根(属41-43)。
7. 南芥族 Arabideae DC.
植株无毛或有单毛、星状毛或分枝毛。雄蕊花丝具宽膜质翅或合生,少有齿状附属物;子房无柄,少有短柄;花柱短,柱头扁压或头状或2裂。长角果线形或狭条形,少数为短角果;子叶缘倚胚根(属44-59)。
8. 紫罗兰族 Matthioleae O. E. Schulz
植株有单毛、叉状毛、星状毛、分枝毛或腺毛。雄蕊花丝线形,内侧的常伸长,有时每2个连接;子房无柄;花柱柱头圆锥形,2裂或下延,少有头状。长角果条形、圆柱形或长椭圆形,开裂或不开裂;子叶缘倚胚根(属60-66)。
9. 香花芥族 Hesperideae Prantl
植株被单毛、贴生二叉或三叉毛。侧蜜腺有各种形状;中蜜腺有或无。花丝无附片,离生,少数4长雄蕊成对连合;花药长圆形;子房无柄或有短柄;柱头浅2裂。长角果,少数为短角果,开裂或不开裂,有时横裂;种子无翅,少有具不明显的翅或稍有翅;子叶背倚或少数缘倚胚根(属67-78)。
10. 大蒜芥族 Sisymbrieae DC.
植株有单毛、二叉毛、星状毛或分枝毛,有时有腺毛。侧蜜腺稍呈环状,中蜜腺瘤状或无中蜜腺;花丝无齿,有的基部变宽;柱头扁压,头状,浅2裂。长角果或短角果,果瓣呈龙骨状隆起;花柱短,很少无;种子少有翅;子叶背倚胚根或斜背倚胚根(属79-95)。
(1) 葱芥亚族 Alliariinae (Prantl) O. E. Schulz
无毛或有单毛。总状花序有苞片;花白色,侧蜜腺环状或半环状,中蜜腺圆锥状;花丝条形。果实宽条形或长圆形,开裂;隔膜薄,常穿孔。种子大,种子有纵沟纹,遇水无粘液物(属79-81) 。
(2) 大蒜芥亚族 Sisymbriinae (Prantl) O. E. Schulz
无毛或有单毛,少为分枝毛。叶多数为大头羽状裂。总状花序无苞片;花黄色。玫瑰红色或紫色;侧蜜腺围绕短雄蕊,向内开口,呈方形或六角形环状,于侧部常呈波状,中蜜腺位于长雄蕊外侧,波状或有时为圆锥形,二者汇合;花丝细。角果线形或条形,开裂,隔膜完整,很少穿孔。种子小,种皮近光滑,或有颗粒状网纹(属82-83)。
(3) 粗杆芥亚族 Pachycladinae O. E. Schulz
无毛或有近黑色单毛。叶全缘或具齿,很少羽状裂。花白色或红色,偶为黄色;蜜腺汇合,侧蜜腺环状,或马蹄形,向内开口,中蜜腺窄念珠状;花丝线形,偶在基部变宽;短角果椭圆形或长圆形,开裂;隔膜完整或不完整,柔软。种皮光滑,有近透明的颗粒或网纹,遇水无粘液物(属84)。
(4) 肉叶荠亚族 Brayinae O. E. Schulz
无毛或有单毛、分枝毛。叶为单叶,全缘或有齿。总状花序或单花生于花葶上,白色、红色或黄色;侧蜜腺1对,位于短雄蕊两侧,中蜜腺无或很少有,不与侧蜜腺汇合;花丝基部扩大。长角果或短角果,开裂。种皮近光滑,遇水无粘液物(属85-90)。
(5) 亚麻荠亚族 Camelininae O. E. Schulz
被单毛与短分枝毛。单叶或羽状复叶,全缘。总状花序无苞片;花黄色;侧蜜腺长肾形,位于短雄蕊两侧,无中蜜腺;短角果,易开裂,果瓣膨胀。种子遇水有粘液物(属91)。
(6) 播娘蒿亚族 Descurainiinae O. E. Schulz
被单毛、分枝毛或腺毛。叶多为2回羽状深裂。总状花序无苞片;花黄色、白色或玫瑰红色;侧蜜腺球状,中蜜腺念珠状;花丝细或条状。长角果或短角果,开裂,隔膜完整,很少穿孔。种子遇水常有粘液物(属92-95)。 族亚族属庭荠族
Trib. Alysseae Gren. et Godr. 庭荠属 Alyssum
团扇荠属 Berteroa
香雪球属 Lobularia
燥原荠属 Ptilotricum 南芥族
Trib. Arabideae DC. 鼠耳芥属 Arabidopsis
南芥属 Arabis
山芥属 Barbarea
碎米荠属 Cardamine
高原芥属 Christolea
异蕊芥属 Dimorphostemon
花旗杆属 Dontostemon
弯蕊芥属 Loxostemon
豆瓣菜属 Nasturtium
堇叶芥属 Neomartinella
腋花芥属 Parryodes
单花荠属 Pegaeophyton
藏芥属 Phaeonychium
蔊菜属 Rorippa
曙南芥属 Stevenia
旗杆芥属 Turritis 芸苔族
Trib. Brassiceae Hayek 芸苔属 Brassica
线果芥属 Conringia
两节荠属 Crambe
二行芥属 Diplotaxis
芝麻菜属 Eruca
诸葛菜属 Orychophragmus
萝卜属 Raphanus
白芥属 Sinapis 葶苈族
Trib. Drabeae O. E. Schulz 辣根属 Armoracia
穴丝荠属 Coelonema
葶苈属 Draba 乌头荠族
Trib. Euclidieae DC. 匙荠属 Bunias
乌头荠属 Euclidium
绵果荠属 Lachnoloma
脱喙荠属 Litwinowia
球果荠属 Neslia
螺喙荠属 Spirorhynchus
舟果荠属 Tauscheria 香花芥族
Trib. Hesperideae Prantl 异药芥属 Atelanthera
桂竹香属 Cheiranthus
香芥属 Clausia
隐子芥属 Cryptospora
糖芥属 Erysimum
四棱荠属 Goldbachia
香花芥属 Hesperis
丝叶芥属 Leptaleum
涩荠属 Malcolmia
簇芥属 Pycnoplinthus
棒果芥属 Sterigmostemum
棱果芥属 Syrenia 独行菜族
Trib. Lepidieae DC. 荠属 Capsella
群心菜属 Cardaria
岩荠属 Cochlearia
臭荠属 Coronopus
双脊荠属 Dilophia
蛇头荠属 Dipoma
藏荠属 Hedinia
半脊荠属 Hemilophia
薄果荠属 Hymenolobus
屈曲花属 Iberis
菘蓝属 Isatis
独行菜属 Lepidium
弯梗芥属 Lignariella
高河菜属 Megacarpaea
双果荠属 Megadenia
厚壁荠属 Pachypterygium
宽框荠属 Platycraspedum
沙芥属 Pugionium
革叶荠属 Stroganowia
菥蓂属 Thlaspi 紫罗兰族
Trib. Matthioleae O. E. Schulz 离子芥属 Chorispora
异果芥属 Diptychocarpus
紫罗兰属 Matthiola
小柱芥属 Microstigma
条果芥属 Parrya
丛菔属 Solms-Laubachia
四齿芥属 Tetracme 大蒜芥族
Trib. Sisymbrieae DC. 葱芥亚族
Subtrib. Alliariinae (Prantl) O. E. Schulz 葱芥属 Alliaria
山萮菜属 Eutrema
沟子荠属 Taphrospermum 肉叶荠亚族
Subtrib. Brayinae O. E. Schulz 锥果芥属 Berteroella
肉叶荠属 Braya
无隔荠属 Staintoniella
连蕊芥属 Synstemon
盐芥属 Thellungiella
念珠芥属 Torularia 亚麻荠亚族
Subtrib. Camelininae O. E. Schulz 亚麻荠属 Camelina播娘蒿亚族
Subtrib. Descurainiinae O. E. Schulz 播娘蒿属 Descurainia
芹叶荠属 Smelowskia
羽裂叶荠属 Sophiopsis
阴山荠属 Yinshania 粗杆芥亚族
Subtrib. Pachycladinae O. E. Schulz 寒原荠属 Aphragmus大蒜芥亚族
Subtrib. Sisymbriinae (Prantl) O. E. Schulz. 葱芥属 Alliaria
寒原荠属 Aphragmus
锥果芥属 Berteroella
肉叶荠属 Braya
亚麻荠属 Camelina
播娘蒿属 Descurainia
山萮菜属 Eutrema
小蒜芥属 Microsisymbrium
大蒜芥属 Sisymbrium
芹叶荠属 Smelowskia
羽裂叶荠属 Sophiopsis
无隔荠属 Staintoniella
连蕊芥属 Synstemon
沟子荠属 Taphrospermum
盐芥属 Thellungiella
念珠芥属 Torularia
阴山荠属 Yinshania 长柄芥族
Trib. Stanleyeae O. E. Schulz 长柄芥属 Macropodium