根据上述职责，市政府办公室内设机构17个：
1、综合一科
负责组织市政府主要领导同志的文稿起草和公务活动安排；根据领导同志指示和工作需要开展调查研究；办理市政府主要领导分管联系部门的文电、会务、督查、调研工作；承办市政府有关综合业务方面的重要文稿；联系市长协会及综合秘书网络的业务工作。
2、综合二科
负责市政府常务副市长的文稿起草和公务活动安排；办理常务副市长分管联系工作方面及相关部门的文电、会务、督查、调研工作；负责联系陇海兰新促进会有关业务。
3、综合三科（市政府救灾办公室）
负责市政府分管农口工作领导同志的文稿起草和公务活动安排；办理农口方面及领导同志联系部门的文电、会务、督查、调研工作；负责市政府救灾工作领导小组办公室的日常工作。
4、综合四科
负责市政府分管工业口工作领导同志的文稿起草和公务活动安排；办理工业口方面及领导联系部门的文电、会务、督查、调研工作。
5、综合五科
负责市政府分管城乡建设口工作领导同志的文稿起草和公务活动安排；办理建设口方面及领导联系部门的文电、会务、督查、调研工作。
6、综合六科
负责市政府分管文教口工作领导同志的文稿起草和公务活动安排；办理文教口方面及领导联系部门的文电、会务、督查、调研工作。
7、综合七科
负责市政府分管商贸口工作领导同志的文稿起草和公务活动安排；办理商贸口方面及领导联系部门的文电、会务、督查、调研工作；负责市政府领导同志以及办公室招商引资项目任务的协调、落实工作；负责联系亚欧大陆桥论坛有关业务。
8. 综合八科
负责市政府分管政府融资、金融保险等工作领导同志的文稿起草和公务活动安排；办理相关方面和领导分管及联系部门的文电、会务、督查、调研工作。
9、秘书科
承办市政府全体会议、常务会议、党组会议、市长周例会和市政府重大会议的筹备组织工作，起草会议纪要，协助有关科室做好会议决定事项的督办落实工作；承办市政府和办公室领导公务活动安排、公务迎送与接待工作；负责办公室内部日常事务和挂靠与代管机构有关事项的综合协调，安排办公室内部各类会议和活动；负责办公室机关和所属单位的目标考核管理、组织人事、机构编制、教育培训等工作；承办市政府和办公室领导的服务保障和通信员的管理工作；负责机关电话总机管理和会议室的管理服务工作；承办办公室对外宣传和国内友好城市联络工作。
10、信息科（《咸阳市人民政府公报》社）
向省政府和市政府报送政务信息，开展信息调研，协调指导全市政府系统政务信息工作；收集、分析、上报网络媒体有关重要信息，掌握舆情动态；编发《咸阳市人民政府公报》；整理市政府工作大事记；负责市内外政务信息交流；负责市政府、市政府办公室的政务公开工作，指导、协调、监督市政府各部门和全市各级政府电子政务和政务公开工作。
11、机要科
承担各类来文来电的接收、登记、转办、传递、归档工作；复核、印刷、分发以市政府、市政府办公室名义印发的各类重要文稿；负责市政府、市政府办公室印鉴的管理、使用和市政府各部门、各县市区以及县级企事业单位印鉴的颁发、回收、销毁工作；负责各级领导批示件的登记、转办工作；负责办公室自动化办公系统的规划、建设、管理、日常维护工作；做好市政府办公室机关保密工作。
12、财务科
负责市政府办公室行政经费的管理；负责市政府及办公室公务活动的预决算和后勤保障事项；承办机关的养老保险、医疗保险、住房公积金等有关业务；负责离退休人员及遗属服务管理工作；负责市政府办公室内部对口接待有关工作。
13、行政科
承办市政府机关大院房地产管理、办公用房修缮、水电暖管理、环卫绿化、爱国卫生活动以及市级机关事务管理方面的有关工作；负责市政府机关大院内部安全保卫、户籍管理、文明大院创建工作；负责市政府办公室后勤行政事务管理、精神文明建设、计划生育和车辆调度、使用、管理工作；承担市本级公共机构的节能工作，指导、监督下级公共机构的节能工作；配合有关部门处理赴市政府机关集体上访事件。
14、市应急管理办公室（市政府总值班室）
负责市政府、市应急管理委员会的日常工作；协助市政府领导同志做好由市政府组织处理的突发事件的处置工作；负责全市应急体系规划和建设工作，指导检查全市应急管理工作；负责市政府的值班工作和群众信访接待；负责向省政府办公厅报送重大突发事件及处置情况信息；办理应急管理方面的文电、会务、督查、调研工作；负责承办领导交办的其他工作。设值守应急科、综合协调科。
15、市政府法制办公室
负责对全市行政机关推进依法行政工作的监督检查，建立和落实依法行政监督的相关制度，协调有关部门和机构做好依法行政监督工作；协调部门之间在有关法律、法规、规章实施中的矛盾和争议，受理行政违法案件的投诉；拟订市政府规范性文件的年度计划并组织实施，负责市政府规范性文件的审查、备案、清理等工作；承办市政府的行政复议案件；指导和办理行政诉讼、行政赔偿工作；指导市政府部门和县区政府法制工作。设复议监督科和法规应诉科。
16、市政府研究室
组织开展全市经济社会发展重大问题的调查研究和决策咨询论证工作；参与研究全市经济社会发展规划；参与有关重要文件、讲话的起草、修改工作；负责政府系统调研协调及成果评选与合作交流。
17、市政务大厅管理委员会办公室
承办并监督市政府授权在大厅办理的行政审批工作；负责为各类投资者办理所申请的各项批文和证照；协助办理各类投资项目的审批手续；协助投资者处理和解决生产经营过程中一些具体困难和问题；办理有关便民服务事项；承办领导交办的其他涉及招商引资、改善投资环境方面的工作；协调大厅内各部门之间的工作关系，负责业务指导、业务协调和业务统计；制定政务大厅的各项规章制度、管理办法并组织实施；受理有关投诉和举报，搞好进厅单位及其窗口人员的考核管理工作。设秘书科和业务督查科。
纪检、监察机构按有关文件规定设置。
