国家税务总局是国务院主管税收工作的直属机构，正部级。前身是财政部税务总局（正局级），成立于1950年，1988年改名为国家税务局，为国务院直属机构（副部级），1993年定名为国家税务总局。详见
http://www.chinatax.gov.cn/国家税务局系统的机构设置为四级，即：国家税务总局，省（自治区、直辖市）国家税务局，地(市、州、盟) 国家税务局，县(市、旗) 国家税务局，截至2005 年底，全国税务系统正式在职人员共有74.7万人，其中，国税系统40万人。
国家税务总局对全国国税系统实行垂直管理，协同省级人民政府对省级地方税务局实行双重领导。
国家税务总局设13个内设机构（正司局级）：
（一）办公厅
负责机关文电、机要、会务、档案、信访、保密和保卫等工作；承担税务宣传、政务公开和新闻发布工作；管理机关财务和其他行政事务。
（二）政策法规司
起草税收法律法规草案、部门规章及规范性文件；研究提出税制改革建议；拟订税收业务的规章制度；研究、承办涉及世贸组织有关税收事项；承办重大税收案件的审理和行政处罚工作；承担机关有关规范性文件的合法性审核工作；承办税务行政复议、行政应讼工作。
（三）货物和劳务税司
组织实施增值税、消费税、营业税、车辆购置税等（不含海关代征的）征收管理工作，组织实施出口退税管理工作。
（四）所得税司
组织实施企业所得税、个人所得税和法律法规规定的基金（费）等征收管理工作。
（五）财产和行为税司
组织实施财产与行为各税种及教育费附加等税收业务管理，指导财产与行为各税种及教育费附加的征管业务。
（六）国际税务司
研究拟订国家（地区）间反避税措施，组织实施反避税调查；参加国家（地区）间税收协议、协定谈判，承办草签和执行有关协议、协定等工作；承办与国际机构、国家（地区）间税务机关的合作与交流业务；管理总局机关和国税系统外事工作。
（七）收入规划核算司
编制税收收入中长期规划，编制年度税收任务、出口退税指标；参与起草税款征缴退库制度，监督检查税款缴、退库情况；承办税收收入的分析、预测和重点税源监控管理工作；拟订税收收入规划和税收会计、统计等相关制度；管理税收数据；组织实施税收统计工作。
（八）纳税服务司
组织实施纳税服务体系建设；拟订纳税服务工作规范和操作规程；组织协调、实施纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作，受理纳税人投诉；组织实施税收信用体系建设；指导税收争议的调解；起草注册税务师管理政策，并监督实施。
（九）征管和科技发展司（大企业税收管理司）
起草综合性税收征管规范性文件；拟订税收征收管理的长期规划和综合性方案；管理税收发票和票证；拟订和组织实施税收管理信息化的总体规划和实施方案，承办税收管理信息化建设中业务需求整合和流程优化的综合管理工作；承担对大型企业提供纳税服务工作，实施税源监控和管理，开展纳税评估，组织实施反避税调查与审计；指导海洋石油税收业务。
（十）稽查局
起草税务稽查法律法规草案、部门规章及规范性文件；办理重大税收案件的立案和调查的有关事项并提出处理意见；指导、协调税务系统的稽查工作。
（十一）财务管理司
拟订国税系统财务、基建管理办法；管理国税系统的经费、财务、装备、固定资产；审核汇编国税系统的财务预决算；办理各项经费的领拨。
（十二）督察内审司
组织实施税收法律法规、部门规章及规范性文件执行情况的监督检查；承办国税系统财务、基建、大宗物品采购审计和领导干部经济责任审计工作。
（十三）人事司
拟订国税系统人事制度并组织实施；管理国税系统的人事、机构编制工作，对省级地方税务局局长的任免提出意见；组织实施税务系统思想政治工作和精神文明建设。