问题的根源找到了，随后，研究人员很快就拿出了具体解决的办法。
他们将与液体有关的基压器流量作了调整，从而改变了管路中液体的频率，使之与火箭固有振动频率错开，最终避免了箭体结构的剧烈谐振。
研究人员又对火箭逃逸发动机安全点火机构做了进一步改进。
逃逸塔与庞大的火箭相比虽然不大，但它下面连接着航天员座椅，上面装备有灵巧的逃逸发动机。
研究人员设计这个逃逸装置，其目的自然是：既要求它能够快速应变，帮助航天员“避难”，又要求逃逸装置首先自身不能出问题。所以不妨说，千钧重任系于一塔。
为此，研究人员为的逃逸发动机，又增加了一道保险，即配备了安全点火系统。
安全点火机构的具体结构就是，用一个机械挡板横在点火的位置，用物理隔离的方法将火挡住。因为，物理隔离往往是处理类似问题最保险的方法。这样，就进一步增加了“神舟6号”火箭的保险系数。
最后，为了便于观察、记录“神舟6号”火箭的飞行情况，研究人员还在火箭外部安装摄像监控装置。