蛋白质在紫外吸收的原理：
组成蛋白质的各种氨基酸在可见光区都没有光吸收，而在紫外光区仅色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸有吸收能力。其中色氨酸的最大吸收波长为279nm，酪氨酸的最大吸收波长为278nm，苯丙氨酸的为259nm。利用紫外光法可以测定这些氨基酸的含量。蛋白质在280nm的紫外光吸收可以达最大值，绝大部分是由色氨酸和酪氨酸所引起的。
核酸（包括DNA或RNA）中的嘌呤碱和嘧啶碱均具有共轭双键，使碱基、核苷、核苷酸和核酸在240～290nm的紫外波段有一个强烈的吸收峰，最大吸收值在260nm附近，不同的核苷酸有不同的吸收特性。而蛋白质在这一光区仅有很弱的吸收。
蛋白质和核酸在紫外吸收的差异：
蛋白质和核酸的紫外吸收最大值不同。
均一性不同：核酸的每种碱基都有吸收，而且相差不多，因而定量时线性很好；蛋白的20种构件中只有三种有吸收，相互差异也较大,所以蛋白用紫外吸收定量比较困难。
波长不同：蛋白在280 nm,核酸在260 nm.这取决于生色团,即分子结构.
核酸的带电机理：
核酸和核苷酸既有磷酸基，又有碱性基团，所以在溶液中为两性电解质，因磷酸的酸性强，通常表现为酸性。RNA在室温条件下被稀碱水解成核苷酸而DNA对碱较稳定，常利用该性质测定RNA的碱基组成或除去溶液中的RNA杂质。
蛋白质的带电机理：
氨基酸由于含有氨基和羧基，因此在化学性质上表现为是的一种兼有弱碱和弱酸的两性化合物。氨基酸在溶液中的带电状态，会随着溶液的pH值而变化，如果氨基酸的净电荷等于零，在外加电场中不发生向正极或负极移动的现象，在这种状态下溶液的pH值称为其等电点，常用pI表示。在等电点是，氨基酸的溶解度最小，容易沉淀析出。